RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	RSM28	Q03430	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RAD30	Q04049	632 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ECI1	Q05871	280 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	MLH2	Q07980	695 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TAF10	Q12030	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	KAR3	P17119	729 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	NIP100	P33420	868 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	VTC2	P43585	828 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TOS3	P43637	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ARO80	Q04052	950 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	PLP2	Q12017	286 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	FRE7	Q12333	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	NCA2	Q12374	616 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RTP1	Q12751	981 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	INA22	P40576	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	AXL1	P40851	1208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ATP23	P53722	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TOF1	P53840	1238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	REC107	P21651	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	GPI10	P30777	616 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ECM10	P39987	644 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TPO3	Q06451	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SEY1	Q99287	776 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	LHS1	P36016	881 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	COQ11	Q05892	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	IRC3	Q06683	689 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	CLN3	P13365	580 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YCK1	P23291	538 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	MGM1	P32266	881 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ECM4	P36156	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TDA11	P38854	504 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SGM1	P47166	707 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ERV41	Q04651	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	NMD4	Q12129	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	OCA6	Q12454	224 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	MYO1	P08964	1928 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	CYB2	P00175	591 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	MET8	P15807	274 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	CTK2	P46962	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	BRO1	P48582	844 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ORC5	P50874	479 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	GRX3	Q03835	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	FOB1	O13329	566 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	APN1	P22936	367 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	PRE8	P23639	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	SEC66	P33754	206 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RCK2	P38623	610 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	JHD1	P40034	492 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YJL107C	P42947	387 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	IRC7	P43623	340 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	CHO1	P08456	276 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YME1	P32795	747 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	YBP1	P38315	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ARN1	P38731	627 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	STN1	P38960	494 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRD1	YCL057W	ATF1	P40353	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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