RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	FMP52	P40008	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	NMA2	P53204	395 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	DCS1	Q06151	350 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	NDL1	Q06568	189 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	MED2	Q12124	431 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	VPS63	O13549	108 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	BOS1	P25385	244 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	HIR2	P32480	875 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	TSC10	P38342	320 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	MSG5	P38590	489 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	SSO2	P39926	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	SLG1	P54867	378 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	TEN1	Q07921	160 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	CRT10	Q08226	957 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	TGS1	Q12052	315 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	MTR10	Q99189	972 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ABF1	P14164	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	HNM1	P19807	563 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	AVT1	P47082	602 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	COQ6	P53318	479 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	MRPL22	P53881	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	RAD61	Q99359	647 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	SPS4	P09937	338 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	RAD14	P28519	371 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	LST4	P34239	828 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	APL3	P38065	1025 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	YBR139W	P38109	508 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ICS2	P38284	255 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	LAS21	P40367	830 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ATG27	P46989	271 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	YGL108C	P53139	140 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	LSB1	P53281	241 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	PRM1	P53835	661 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	OCA2	P53949	197 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	TRS23	Q03784	219 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	CYK3	Q07533	885 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	ULA1	Q12059	462 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SEO1	YAL067C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SAG1	P20840	650 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ARA1	P38115	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ASG1	P40467	964 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	IRC24	P40580	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	CIN1	P40987	1014 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YFR018C	P43599	363 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PTR3	P43606	678 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YIP5	P53108	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MPS2	P53159	387 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SMA2	Q04658	369 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	STE23	Q06010	1027 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MCP2	Q06567	569 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PCL8	Q08966	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	COX3	P00420	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PCA1	P38360	1216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RFC3	P38629	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YHR210C	P38893	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	CIN4	P39110	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	GIP4	P39732	760 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	NMD5	P46970	1048 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	COG2	P53271	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PLM2	Q04383	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	HRD3	Q05787	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RRD2	Q12461	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	LAM4	P38800	1345 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SAC3	P46674	1301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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