RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561280.5

CHP1-209, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 4

Gene CHP1, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-209	ENST00000561280	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CHP1-209	ENST00000561280	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CHP1-209	ENST00000561280	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CHP1-209	ENST00000561280	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CHP1-209	ENST00000561280	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CHP1-209	ENST00000561280	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CHP1-209	ENST00000561280	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ORC4	O43929	436 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	SLC16A2	P36021	539 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PDE4D	Q08499	809 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	GBF1	Q92538	1859 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TNKS	O95271	1327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	KPNA6	O60684	536 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	CALML3	P27482	149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ALX1	Q15699	326 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	SCLY	Q96I15	445 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RFC2	P35250	354 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RABGGTB	P53611	331 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	SCFD2	Q8WU76	684 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	NFIB	O00712	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	CYP2C9	P11712	490 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PTGS1	P23219	599 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	NOV	P48745	357 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	BFSP2	Q13515	415 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TTC14	Q96N46	770 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	NCOR1	O75376	2440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	FGA	P02671	866 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	FGR	P09769	529 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	LCT	P09848	1927 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	FOXP2	O15409	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	PDHB	P11177	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	COL9A1	P20849	921 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHP1-209	ENST00000561280	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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