RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 TSPY3P0CV98 308 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 TSPY8P0CW00 308 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 MCCP23508 829 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC1A4P43007 532 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 TFAP4Q01664 338 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 TAP1Q03518 808 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 SNAP25P60880 206 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC9A7Q96T83 725 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.49■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 RFC2P35250 354 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 KCTD1Q719H9 257 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 LPXNO60711 386 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 APPP05067 770 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 PDE4BQ07343 736 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 PITPNM1O00562 1244 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 IQCF3P0C7M6 154 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 ACTN1P12814 892 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 NSMFQ6X4W1 530 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 HLA-CQ95604 372 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-214ENST00000560163 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 ICAM1P05362 532 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 CPT1AP50416 773 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 TET1Q8NFU7 2136 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 GPR37L1O60883 481 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 MYL3P08590 195 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 NOVP48745 357 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PPARAQ07869 468 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 GRB10Q13322 594 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 SPRED2Q7Z698 418 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PTPRSQ13332 1948 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 STX8Q9UNK0 236 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 A6NJR5 290 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 NMT2O60551 498 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 KIF28PB7ZC32 967 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 NFIBO00712 420 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 GPNMBQ14956 572 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 CD320Q9NPF0 282 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 INCENPQ9NQS7 918 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 BAIAP3O94812 1187 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 RETREG2Q8NC44 543 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
RABGGTA-214ENST00000560163 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 FOXP2O15409 715 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 KPNA6O60684 536 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 BFSP2Q13515 415 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 NAPBQ9H115 298 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 LCHNA4D1U4 455 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 EDNRBP24530 442 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 DCAF4Q8WV16 495 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-214ENST00000560163 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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