RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515332.5

SGMS2-209, Transcript of sphingomyelin synthase 2, human

TSL 3

Gene SGMS2, Length 498 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS2-209	ENST00000515332	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	TSPY3	P0CV98	308 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	TSPY8	P0CW00	308 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	MCC	P23508	829 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	SLC1A4	P43007	532 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	NSMF	Q6X4W1	530 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	SPRED2	Q7Z698	418 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	GMCL1	Q96IK5	515 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	GPR37L1	O60883	481 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	APP	P05067	770 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	RFC2	P35250	354 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	APPBP2	Q92624	585 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	28.9	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	LCT	P09848	1927 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	KIF28P	B7ZC32	967 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	GPAA1	O43292	621 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	KCTD1	Q719H9	257 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	MORC4	Q8TE76	937 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SGMS2-209	ENST00000515332	TFAP4	Q01664	338 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	LPXN	O60711	386 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	IQCF3	P0C7M6	154 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	CPT1A	P50416	773 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	RETREG2	Q8NC44	543 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	CD320	Q9NPF0	282 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332		M0R2C6	588 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	PITPNM1	O00562	1244 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	PLA2G6	O60733	806 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	GNAT2	P19087	354 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	PDE4B	Q07343	736 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	LCHN	A4D1U4	455 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SGMS2-209	ENST00000515332	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	TET1	Q8NFU7	2136 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	KCNJ6	P48051	423 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	STX8	Q9UNK0	236 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	MTMR7	Q9Y216	660 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPRS	Q13332	1948 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	BAIAP3	O94812	1187 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	ICAM1	P05362	532 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	BFSP2	Q13515	415 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	MS4A1	P11836	297 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	NOD1	Q9Y239	953 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	NFIB	O00712	420 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	PPARA	Q07869	468 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	COPS5	Q92905	334 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	RAD50	Q92878	1312 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	NMT2	O60551	498 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	CHMP4BP1	P59074	171 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	PIEZO1	Q92508	2521 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	CCDC96	Q2M329	555 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SGMS2-209	ENST00000515332	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		28.77	■■■□□ 2.2

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