RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM32Q13049 653 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 ACVR2BQ13705 512 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 C8orf34Q49A92 452 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 ARMCX2Q7L311 632 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 MICU3Q86XE3 530 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 BRF1Q92994 677 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SHISA4Q96DD7 197 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PIGSQ96S52 555 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CPVLQ9H3G5 476 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 Q9Y3F1 56 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CNTN2Q02246 1040 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 FUT2Q10981 343 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 USH1GQ495M9 461 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 TRPV1Q8NER1 839 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 KATNBL1Q9H079 304 aa14.11□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 DNM1LO00429 736 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 STAM2O75886 525 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 POLR2MP0CAP2 368 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 RARBP10826 455 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 MCTP2Q6DN12 878 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 MYL10Q9BUA6 226 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.1□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 OPLAHO14841 1288 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 IFNAR1P17181 557 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 HOMER1Q86YM7 354 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 SPC25Q9HBM1 224 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 ASTN1O14525 1302 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNQ1-203ENST00000345015 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CALML3P27482 149 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CNGA1P29973 690 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 APOBRQ0VD83 1088 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF180Q86T96 592 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CUL5Q93034 780 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 RMDN3Q96TC7 470 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.08□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 LCTP09848 1927 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CEP290O15078 2479 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 MCM3APO60318 1980 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 ESYT2A0FGR8 921 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CDKL5O76039 1030 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CFBP00751 764 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 TGFB3P10600 412 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 COL6A1P12109 1028 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CPA1P15085 419 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 RXRAP19793 462 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 GJA9P57773 515 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 PDE4DQ08499 809 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 STXBP2Q15833 593 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 NTRK3Q16288 839 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.07□□□□□ -0.16
KCNQ1-203ENST00000345015 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms