RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	MRPL36	P36531	177 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	NAT2	P37293	288 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	BUR6	P40096	142 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	ALT2	P52892	507 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	COG1	P53079	417 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	ZDS2	P54786	942 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	BNA5	Q05979	453 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	MLC2	Q06580	163 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	YLR108C	Q12259	485 aa		0.93	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	PRB1	P09232	635 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	PEP5	P12868	1029 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	YBR138C	P38277	524 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TSC10	P38342	320 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	UIP3	P39547	235 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	PAN6	P40459	309 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	BSC5	P53755	489 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	GOR1	P53839	350 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	NKP1	Q12493	238 aa		0.92	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-F	P0CX61	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-C	P25383	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	GWT1	P47026	490 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	SGM1	P47166	707 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	SLD5	Q03406	294 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	RSN1	Q03516	953 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	ECM11	Q04110	302 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	IVY1	Q04934	453 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	RFM1	Q12192	310 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-B	Q12260	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	PRM7	Q12459	698 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	YOR019W	Q99248	730 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		0.91	□□□□□ -2.26
snR46	snR46	TPK1	P06244	397 aa		0.9	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	MRPL10	P36520	322 aa		0.9	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	BUD32	P53323	261 aa		0.9	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	VHS1	Q03785	461 aa		0.9	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YPQ1	Q12010	308 aa		0.9	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YBR085C-A	O43137	85 aa		0.89	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	ELO1	P39540	310 aa		0.89	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	PUG1	P40100	303 aa		0.89	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	SPC72	P39723	622 aa		0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	PSF2	P40359	213 aa		0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	CHS6	P40955	746 aa		0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	IME4	P41833	600 aa		0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	PTR3	P43606	678 aa		0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	MDG1	P53885	366 aa		0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	TEN1	Q07921	160 aa		0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YCR007C	P25354	239 aa		0.87	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	RSM22	P36056	628 aa		0.87	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	HST1	P53685	503 aa		0.87	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YRM1	Q12340	786 aa		0.87	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	ERG8	P24521	451 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	NDI1	P32340	513 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	MNS1	P32906	549 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YKL100C	P34248	587 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	KKQ8	P36004	724 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	DUG2	P38149	878 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	NPR3	P38742	1146 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	NCA3	P46955	337 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	AVT4	P50944	713 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	DIA3	P52290	468 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	IBD2	P53892	351 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	NUS1	Q12063	375 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	PCD1	Q12524	340 aa		0.86	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	UTR4	P32626	227 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YKL133C	P36066	463 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	TIM17	P39515	158 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	PRM5	P40476	318 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	DSD1	P53095	428 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	REG1	Q00816	1014 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	PHO92	Q06390	306 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	YDL057W	Q07379	328 aa		0.85	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	NUC1	P08466	329 aa		0.84	□□□□□ -2.27
snR46	snR46	RAD16	P31244	790 aa		0.84	□□□□□ -2.27

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.9 ms