RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	YFR018C	P43599	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	FAR3	P46671	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	AIM23	P47015	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NUP84	P52891	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SAP4	P53036	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	FLC3	P53121	802 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PRM1	P53835	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RPN4	Q03465	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PPN1	Q04119	674 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	OPI10	Q08202	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PEX11	Q12462	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	UBR1	P19812	1950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	REV1	P12689	985 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
TRM10	YOL093W	BET2	P20133	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	KIN3	P22209	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GEX1	P25596	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YKL100C	P34248	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MRP8	P35719	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GEX2	P36173	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	LDB7	P38210	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YHI9	P38765	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YHR182W	P38870	785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	DUN1	P39009	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HAT2	P39984	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PEP8	P40335	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ATF1	P40353	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	AIM14	P53109	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YNL143C	P53908	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	REG1	Q00816	1014 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NUP100	Q02629	959 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CCE1	Q03702	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YHM2	Q04013	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SEC10	Q06245	871 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MCP2	Q06567	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HEM2	P05373	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ENA1	P13587	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RSR1	P13856	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ABF1	P14164	731 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SNT1	P25357	1226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	BEM1	P29366	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	BEM3	P32873	1128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SRP101	P32916	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	STE13	P33894	931 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
TRM10	YOL093W	PHO89	P38361	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MNN1	P39106	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ALG8	P40351	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HOS4	P40480	1083 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TDA10	P42938	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YFL012W	P43580	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PET130	P47065	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	AMA1	P50082	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MNT2	P53059	558 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SFB2	P53953	876 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	UBX4	P54730	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	OSH6	Q02201	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SPP2	Q02521	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TFB2	Q02939	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PIR1	Q03178	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CIA1	Q05583	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	BLS1	Q06071	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SGO1	Q08490	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NDD1	Q08887	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GTT2	Q12390	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MPD2	Q99316	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GDA1	P32621	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SWE1	P32944	819 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HSM3	P38348	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MRX1	P40050	688 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PAN6	P40459	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	AXL1	P40851	1208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MET12	P46151	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NNF1	P47149	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	BOL2	P53082	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YGR012W	P53206	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GND2	P53319	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	BUD32	P53323	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	IPI3	P53877	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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