RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	DUG3	P53871	357 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	BNA5	Q05979	453 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SDH5	Q08230	162 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	YIM1	P28625	365 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	YME1	P32795	747 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SLZ1	P40167	298 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	TIS11	P47977	285 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	CTF3	Q12748	733 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	FRE1	P32791	686 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	CNS1	P33313	385 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.48	□□□□□ -1.85	not detected
CSI1	YMR025W	BUD32	P53323	261 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	PSR1	Q07800	427 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	PEP5	P12868	1029 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	CBF2	P32504	956 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	ALY1	P36117	915 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	NDT80	P38830	627 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	ALT2	P52892	507 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SHR3	Q02774	210 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	SPR1	P32603	445 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	XRS2	P33301	854 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YBL059W	P34224	193 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YKL100C	P34248	587 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	UME6	P39001	836 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	HAT2	P39984	401 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YGR210C	P42942	411 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	RCO1	Q04779	684 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	TRM8	Q12009	286 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	MRP20	P32387	263 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	FMP10	P40098	244 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	SNG1	P46950	547 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	SLD5	Q03406	294 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	TMS1	Q12116	473 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	ADH7	P25377	361 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
CSI1	YMR025W	TOM20	P35180	183 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	SWD3	P38123	315 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YLR152C	P54072	576 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	SGF29	P25554	259 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	SYN8	P31377	255 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	BNA1	P47096	177 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	ERV2	Q12284	196 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	HRT3	Q12347	344 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	VMA16	P23968	213 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YIL067C	P40514	678 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	IRC15	Q02733	499 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	PBA1	Q05778	276 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	VPS74	Q06385	345 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	CLN3	P13365	580 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YCR007C	P25354	239 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	MRP4	P32902	394 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	PTR3	P43606	678 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	YJR154W	P47181	346 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	DSD1	P53095	428 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	MSC1	Q03104	513 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CSI1	YMR025W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	IVY1	Q04934	453 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	VID22	Q05934	901 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
CSI1	YMR025W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	DBF20	P32328	564 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	NUP133	P36161	1157 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	AAD10	P47182	288 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	EFM6	P53970	246 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	ARK1	P53974	638 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	UBX4	P54730	416 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	RRN11	Q04712	507 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	BOS1	P25385	244 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	ICS2	P38284	255 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	GWT1	P47026	490 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	YGR126W	P53274	230 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CSI1	YMR025W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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