RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	YBR144C	P34215	104 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YER130C	P39959	443 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YTA12	P40341	825 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	DSD1	P53095	428 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RHO4	Q00246	291 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YPL014W	Q02606	381 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	MSC1	Q03104	513 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	DIC1	Q06143	298 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YEH1	Q07804	573 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YEH2	Q07950	538 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SGS1	P35187	1447 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	PMS1	P14242	873 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	IMP2'	P32351	346 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	VPS17	P32913	551 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SEF1	P34228	1148 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YJL068C	P40363	299 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SNG1	P46950	547 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YGL260W	P53056	76 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YGR126W	P53274	230 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CRZ1	P53968	678 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	SAM50	P53969	484 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CDC45	Q08032	650 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	CTI6	Q08923	506 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	YPT6	Q99260	215 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YLR224W	YLR224W	PEP5	P12868	1029 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	ECM15	P35195	104 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	UBP11	P36026	717 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	REG2	P38232	338 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	ALG5	P40350	334 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	MRX6	P48564	524 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	ALT2	P52892	507 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YGR066C	P53242	292 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	SHR3	Q02774	210 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	THI20	Q08224	551 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	DAP1	Q12091	152 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	GCN4	P03069	281 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PHO2	P07269	559 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YML002W	P0CF17	737 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	MRP13	P12686	339 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	CBS1	P14066	229 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YHR210C	P38893	341 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YJR154W	P47181	346 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	IPI3	P53877	555 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	RBA50	Q04418	439 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	GLO2	Q05584	274 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	TIP41	Q12199	356 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	RRI2	Q12348	645 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	SEC62	P21825	274 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PEP3	P27801	918 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	CSM2	P40465	213 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	BUD32	P53323	261 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	VPS75	P53853	264 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	FIN1	Q03898	291 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YOR365C	Q08844	703 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.88	□□□□□ -1.95	not detected
YLR224W	YLR224W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.87	□□□□□ -1.95	not detected
YLR224W	YLR224W	MRS3	P10566	314 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	APE1	P14904	514 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	MET8	P15807	274 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	OCA4	P25366	362 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	RMD8	P43620	662 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	IKS1	P47042	667 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	TOF2	Q02208	771 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YMR087W	Q04299	284 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	SCW10	Q04951	389 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	COQ9	Q05779	260 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	RLM1	Q12224	676 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	AVL9	Q12500	764 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YCR007C	P25354	239 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PRD1	P25375	712 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YLR224W	YLR224W	YME1	P32795	747 aa		2.86	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.1 ms