RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SET6	Q12529	373 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PSK1	P31374	1356 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	CLB1	P24868	471 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SNC1	P31109	117 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YKL050C	P35736	922 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	COG1	P53079	417 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PEX8	P53248	589 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	MRS2	Q01926	470 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SIR4	P11978	1358 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YSP2	Q06681	1438 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	BNI1	P41832	1953 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	GAL1	P04385	528 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	TPK1	P06244	397 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SPE2	P21182	396 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PTP2	P29461	750 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	DEP1	P31385	405 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	AGA1	P32323	725 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	NDC1	P32500	655 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	RRT2	P38332	387 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	COS10	P52924	374 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	RBA50	Q04418	439 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YOL057W	Q08225	711 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	COX17	Q12287	69 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	LYS2	P07702	1392 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	KRE5	P22023	1365 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	RPN12	P32496	274 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SWI3	P32591	825 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	VPS17	P32913	551 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PCA1	P38360	1216 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PSF2	P40359	213 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
SYS1	YJL004C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SML1	Q04964	104 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SSK1	Q07084	712 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	BSC6	Q08280	497 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SFI1	Q12369	946 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PHO81	P17442	1178 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PTR2	P32901	601 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	AGP2	P38090	596 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	ARP1	P38696	384 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	UBA4	P38820	440 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	RPR2	P40571	144 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YMR102C	Q03177	834 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	VPS72	Q03388	795 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YRF1-2	P40105	1681 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	DRS2	P39524	1355 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SNF3	P10870	884 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SEC62	P21825	274 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	RAD51	P25454	400 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YCL049C	P25577	312 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PGS1	P25578	521 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	ECM15	P35195	104 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	UIP3	P39547	235 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	YNL050C	P53952	270 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	SAM50	P53969	484 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	GRC3	Q07845	632 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	THI20	Q08224	551 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	ATG9	Q12142	997 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	INP53	Q12271	1107 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SYS1	YJL004C	DAL5	P15365	543 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	RAD16	P31244	790 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	IDP2	P41939	412 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	HST1	P53685	503 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	MDG1	P53885	366 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	NKP1	Q12493	238 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	SEC39	Q12745	709 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	RAD50	P12753	1312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	RAD3	P06839	778 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	ATS1	P31386	333 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	MRPL10	P36520	322 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	LAG1	P38703	411 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	YMR160W	Q03823	816 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	GRX3	Q03835	250 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	ERV41	Q04651	352 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SYS1	YJL004C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93

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