RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	BZZ1	P38822	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	YIR014W	P40570	242 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	CUL3	P53202	744 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SOL4	P53315	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	YSA1	Q01976	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	ERO1	Q03103	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	TCO89	Q08921	799 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	HIR3	P47171	1648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	MER1	P16523	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PXA2	P34230	853 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	GUF1	P46943	645 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SHE10	P53075	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PKP2	P53170	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	DSL1	P53847	754 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	EFM6	P53970	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	ARP6	Q12509	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	ARG81	P05085	880 aa		4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	CDC16	P09798	840 aa		4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	CLN1	P20437	546 aa		4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	DBP8	P38719	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RAD30	Q04049	632 aa		4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RNH1	Q04740	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SEM1	O94742	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SNC1	P31109	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	KDX1	P36005	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	ERG7	P38604	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RTS1	P38903	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	VTC2	P43585	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SAD1	P43589	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	FAR3	P46671	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SMA1	Q02651	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	APC2	Q12440	853 aa		4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SNF3	P10870	884 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	BAR1	P12630	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PPZ1	P26570	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	CHS3	P29465	1165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PHD1	P36093	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	MIC60	P36112	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	MAL33	P38157	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	LAG1	P38703	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	SPT8	P38915	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RSC1	P53236	928 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	YGR127W	P53275	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	NRT1	Q08485	598 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	BSC1	Q12140	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
WSS1	YHR134W	PET123	P17558	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	MRPL25	P23369	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RRF1	P38771	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ANS1	P38832	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	POP2	P39008	433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YTA12	P40341	825 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	YJL070C	P40361	888 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	HOP2	P53187	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
WSS1	YHR134W	PNG1	Q02890	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	ARV1	Q06541	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	NMD4	Q12129	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	SYN8	P31377	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	PAH1	P32567	862 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	COY1	P34237	679 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	NUP133	P36161	1157 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	PEX18	P38855	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	FLC2	P39719	783 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	RTT105	P40063	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	NDE1	P40215	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
WSS1	YHR134W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 573.4 ms