RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	RTG1	P32607	177 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	GMH1	P36125	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ACO2	P39533	789 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ERV46	P39727	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YFR018C	P43599	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TEL2	P53038	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	NUT2	Q06213	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	VIK1	Q12045	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RHO2	P06781	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GUT2	P32191	649 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FTH1	P38310	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ARN1	P38731	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	IES5	P40060	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YML096W	Q04489	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	THI73	Q07904	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ATP12	P22135	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YCR099C	P25657	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	STB6	P36085	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MUM2	P38236	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YGR016W	P53209	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CDA1	Q06702	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PLB3	Q08108	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RKM5	Q12367	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ATP6	P00854	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CSM1	P25651	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YHI9	P38765	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CAB2	P40506	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	BIR1	P47134	954 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ARH1	P48360	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ARP4	P80428	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
MSH1	YHR120W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SPC2	Q04969	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ATG34	Q12292	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YSR3	P23501	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PHO91	P27514	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RPC82	P32349	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	TOM20	P35180	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	OCA5	P38738	679 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YAT1	P80235	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RCO1	Q04779	684 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FMP42	Q04991	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GLO2	Q05584	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	BLS1	Q06071	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HDA3	Q06623	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ASA1	Q06822	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MSH5	Q12175	901 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NHA1	Q99271	985 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	VPS34	P22543	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PHO3	P24031	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MEF1	P25039	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ATP7	P30902	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	VRP1	P37370	817 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GOS1	P38736	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ELO1	P39540	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	FMP32	P43557	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SLM2	P53955	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CCE1	Q03702	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YET2	Q04210	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	VTA1	Q06263	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ENT4	Q07872	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GTT2	Q12390	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CNA1	P23287	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PPH21	P23594	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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