RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YOL107W	Q12239	342 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GAL7	P08431	366 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SPS1	P08458	490 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SLY1	P22213	666 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ATG15	P25641	520 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YKL077W	P36081	392 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YRO2	P38079	344 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	LDB7	P38210	180 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	PLB1	P39105	664 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MND2	P40577	368 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GTS1	P40956	396 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MAD1	P40957	749 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	IME4	P41833	600 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YJL049W	P47048	450 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	FDC1	Q03034	503 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YLR287C	Q05881	355 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NUT2	Q06213	157 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GRS2	Q06817	618 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TEN1	Q07921	160 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GTT2	Q12390	233 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PCT1	P13259	424 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	NAM9	P27929	486 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MEI5	P32489	222 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SFC1	P33303	322 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	CAB3	P36076	571 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	STB6	P36085	766 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PTC7	P38797	343 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SHU2	P38957	223 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	BEM4	P39011	633 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PEX7	P39108	375 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	ALG8	P40351	577 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	ALY2	P47029	1046 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	FHN1	P53279	174 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	EFM6	P53970	246 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	BLS1	Q06071	122 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	COX1	P00401	534 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	ORC2	P32833	620 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.63	□□□□□ -1.51	not detected
SYF2	YGR129W	ARG2	P40360	574 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	GAT1	P43574	510 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SAM37	P50110	327 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	TPP1	Q03796	238 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	TRM12	Q04235	462 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YDR278C	Q05612	105 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	VTA1	Q06263	330 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	IRC13	Q08630	104 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	ATG9	Q12142	997 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YLL056C	Q12177	298 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	CDC26	P14724	124 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	CMP2	P14747	604 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	GRR1	P24814	1151 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	BUB3	P26449	341 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	LST4	P34239	828 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	UBA4	P38820	440 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MBP1	P39678	833 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SAW1	P39735	261 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SLS1	P42900	643 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	NNF1	P47149	201 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	IBA57	P47158	497 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SGF73	P53165	657 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YGR021W	P53212	290 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SED5	Q01590	340 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MRS2	Q01926	470 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	OMS1	Q06668	471 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	AIM44	Q99299	758 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YCR102C	P25608	368 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	BLI1	P35727	113 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YBP1	P38315	674 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	HIS2	P38635	335 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	SPC72	P39723	622 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	PFA3	P42836	336 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YPR003C	P53394	754 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	JJJ1	P53863	590 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	OSH6	Q02201	448 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	ADY3	Q07732	790 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	AKR2	Q12013	749 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	YOR342C	Q12182	319 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	LDB17	Q12342	491 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SYF2	YGR129W	RAD10	P06838	210 aa		5.6	□□□□□ -1.51

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