RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	DUN1	P39009	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	CIN4	P39110	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SSO2	P39926	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	VFA1	P40080	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	MSS2	P40990	351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	HFM1	P51979	1187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ERG5	P54781	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	RMI1	Q02685	241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	DML1	Q03652	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YAP6	Q03935	383 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	PPN1	Q04119	674 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	UFO1	Q04511	668 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	VPS38	Q05919	439 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SPH1	Q06160	661 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	TCO89	Q08921	799 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	HER1	Q12276	1246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SIR3	P06701	978 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	CLN3	P13365	580 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	CDC42	P19073	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	UTR1	P21373	530 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	DBF2	P22204	572 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	CWH43	P25618	953 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	NAM9	P27929	486 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	GPI10	P30777	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ERG3	P32353	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	LRG1	P35688	1017 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YKL151C	P36059	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YKR051W	P36142	418 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	FLR1	P38124	548 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	FAT1	P38225	669 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YDR089W	P38966	869 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	VAB2	P40003	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SCC4	P40090	624 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	JLP2	P40206	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ATF1	P40353	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	NAS2	P40555	220 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	IMA5	P40884	581 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	LCB2	P40970	561 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	RMR1	P53060	241 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ORM1	P53224	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ASI1	P54074	624 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ARP4	P80428	489 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ATG21	Q02887	496 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	PLP1	Q04004	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	GIM5	Q04493	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	MFB1	Q04922	465 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	RSF1	Q05043	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	PIG1	Q06216	648 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	MCH5	Q08777	521 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	RCN2	Q12044	265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ATG9	Q12142	997 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	HOS1	Q12214	470 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	TPK1	P06244	397 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ADH4	P10127	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	RAP1	P11938	827 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SEC62	P21825	274 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ATP12	P22135	325 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	STE50	P25344	346 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	APL1	P27351	700 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SUA5	P32579	426 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	UTR4	P32626	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YME1	P32795	747 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SHP1	P34223	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	TPO5	P36029	618 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SWC5	P38326	303 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YHL012W	P38709	493 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	YHR182W	P38870	785 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	ALG5	P40350	334 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SUR2	YDR297W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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