RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DSS4	P32601	143 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	LRG1	P35688	1017 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	KTR4	P38131	464 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PHO89	P38361	574 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	VMA7	P39111	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YEL028W	P39989	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RRN7	P40992	514 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YFL052W	P43551	465 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	IML2	P47031	731 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MON1	P53129	644 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TUB4	P53378	473 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
PDI1	YCL043C	SNF12	P53628	566 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YNR063W	P53749	607 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	IPI3	P53877	555 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RSM28	Q03430	361 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RSN1	Q03516	953 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TAF11	Q04226	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ERF2	Q06551	359 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PMT7	Q06644	662 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ULA1	Q12059	462 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	NSL1	Q12143	216 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	LCB4	Q12246	624 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	STE2	D6VTK4	431 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ATP6	P00854	259 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TPK2	P06245	380 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HMG1	P12683	1054 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	VPS33	P20795	691 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DBF2	P22204	572 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	URA10	P30402	227 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	AEP1	P32493	518 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	NGG1	P32494	702 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	NIC96	P34077	839 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YBR225W	P38321	900 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ARN1	P38731	627 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YHR078W	P38799	552 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CYC2	P38909	366 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SHU2	P38957	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ECM10	P39987	644 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	FET5	P43561	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CNN1	P43618	361 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SNG1	P46950	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TWF1	P53250	332 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PNG1	Q02890	363 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HSP31	Q04432	237 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ARP10	Q04549	284 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	GLO2	Q05584	274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YPR084W	Q06821	456 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RAX1	Q08760	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
PDI1	YCL043C	RGS2	Q99188	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	PRC1	P00729	532 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YSP3	P25036	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DMC1	P25453	334 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DAL1	P32375	460 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SRP101	P32916	621 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	FMP23	P38231	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	FIR1	P40020	876 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YJR061W	P40355	935 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ELP2	P42935	788 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MET12	P46151	657 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YJL132W	P47014	750 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	VPS25	P47142	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	SLD3	P53135	668 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YNL095C	P53932	642 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	COG5	P53951	403 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	GCN5	Q03330	439 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	HER2	Q03557	464 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	GRX8	Q05926	109 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	FAR10	Q06001	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	DCS1	Q06151	350 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PDI1	YCL043C	YDR061W	Q12298	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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