RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	NUP120	P35729	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	UBP13	P38187	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RRT2	P38332	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TSC10	P38342	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ERC1	P38767	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SPC72	P39723	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ESBP6	P53918	673 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ECM9	Q02202	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	GGA1	Q06336	557 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	BSP1	Q06604	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DSE3	Q08729	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RAD61	Q99359	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CLB2	P24869	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SAS3	P34218	831 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YKL133C	P36066	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DUN1	P39009	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SNO3	P43544	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PEX8	P53248	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	CIK1	Q01649	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SRL4	Q03085	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	PLP1	Q04004	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	THI3	Q07471	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
POP4	YBR257W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ATR1	P13090	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ITR2	P30606	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MRPL9	P31334	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MGM1	P32266	881 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	ASK1	P35734	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	OCT1	P35999	772 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RCN1	P36054	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TRM5	P38793	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	LRO1	P40345	661 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RIC1	P40395	1056 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MAM33	P40513	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	BFA1	P47113	574 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YGL108C	P53139	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YGR016W	P53209	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	UBX4	P54730	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SND1	Q04007	877 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MGR3	Q04472	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	MED1	Q12321	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP4	YBR257W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	RAD14	P28519	371 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	DAL3	P32459	195 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	GDA1	P32621	518 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	PTH2	P34222	208 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	SLM4	P38247	162 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	SHC1	P39000	512 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	PEA2	P40091	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	YMR134W	P40207	237 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	OPT1	P40897	799 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	SAD1	P43589	448 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	SAE2	P46946	345 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	TLG1	Q03322	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	YML108W	Q03759	105 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	ATG16	Q03818	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	RAD30	Q04049	632 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	SMP3	Q04174	516 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	BCP1	Q06338	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	BUD7	Q08754	746 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP4	YBR257W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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