RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523961.5

CCNC-216, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 5

Gene CCNC, Length 1,152 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-216ENST00000523961 MTMR8Q96EF0 704 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.56□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 POTEB2H3BUK9 544 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 ZBTB5O15062 677 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CPA1P15085 419 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CAPN2P17655 700 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 SMARCA1P28370 1054 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CYP2C19P33261 490 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RGS19P49795 217 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 TRAF1Q13077 416 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 USH1GQ495M9 461 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 APOA5Q6Q788 366 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 NSMFQ6X4W1 530 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 FBXL16Q8N461 479 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 FANCBQ8NB91 859 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 ABCB11O95342 1321 aa14.55□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 NFIBO00712 420 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 ZBTB43O43298 467 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CYTH3O43739 400 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RXRAP19793 462 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 GJA8P48165 433 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 ANAPC15P60006 121 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 Q6ZUG5 572 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RUFY3Q7L099 469 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 MICU3Q86XE3 530 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 DEFB118Q96PH6 123 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 TINF2Q9BSI4 451 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 AMNQ9BXJ7 453 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 MAF1Q9H063 256 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.54□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 SGPL1O95470 568 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CYBAP13498 195 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RCAN1P53805 252 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CNTN2Q02246 1040 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 HOMER1Q86YM7 354 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RGS22Q8NE09 1264 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 BRF1Q92994 677 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 PIGSQ96S52 555 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.53□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.52□□□□□ -0.08
CCNC-216ENST00000523961 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 MSCO60682 206 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 CNGA1P29973 690 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 PPP2R5BQ15173 497 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 RTN1Q16799 776 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 C8orf34Q49A92 452 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 FGD4Q96M96 766 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.52□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 ASB14A6NK59 587 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 SEC24BO95487 1268 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 APOBRQ0VD83 1088 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 TRPV1Q8NER1 839 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 SHISA4Q96DD7 197 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCNC-216ENST00000523961 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms