RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 POTEB2H3BUK9 544 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 MSCO60682 206 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 KATNBL1Q9H079 304 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 GRM4Q14833 912 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 WTAPQ15007 396 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 MYL10Q9BUA6 226 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 LY9Q9HBG7 655 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 PRC1O43663 620 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN2P17655 700 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 DNM1LO00429 736 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 AKR1A1P14550 325 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGS1P23219 599 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 RASEFQ8IZ41 740 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ERICH2A1L162 156 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 PGK1P00558 417 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TROAPQ12815 778 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC41Q15345 812 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CASC1Q6TDU7 716 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 MYADML2A6NDP7 307 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRF2D3W0D1 207 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 EVI5O60447 810 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RARBP10826 455 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CALML3P27482 149 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ACVR2BQ13705 512 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS4O75173 837 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RXRAP19793 462 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 MCM5P33992 734 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 HOMER1Q86YM7 354 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D5Q92609 795 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 MTMR8Q96EF0 704 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCB11O95342 1321 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 KBTBD13C9JR72 458 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 OPLAHO14841 1288 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 FERMT2Q96AC1 680 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGSQ96S52 555 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 COL20A1Q9P218 1284 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB14A6NK59 587 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 SYN1P17600 705 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO11Q86XK2 927 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM184BQ9ULE4 1060 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-218ENST00000511185 DDAH1O94760 285 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF20Q5VTR2 975 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-218ENST00000511185 MORC4Q8TE76 937 aa21.76■■□□□ 1.07
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