RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 STX17P56962 302 aa22.64■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 POTEDQ86YR6 584 aa22.64■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.64■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.64■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 MTMR9Q96QG7 549 aa22.64■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 PSMD1Q99460 953 aa22.64■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 A0A1B0GTH6 734 aa22.63■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 ICA1Q05084 483 aa22.63■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.63■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 CALCRLQ16602 461 aa22.61■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.61■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.61■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.214e-7■■□□□ 11.9
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SERBP1-201ENST00000361219 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.61■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 TNNI2P48788 182 aa22.6■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 SLC37A4O43826 429 aa22.6■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 UBE2SQ16763 222 aa22.6■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.59■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 BAG6P46379 1132 aa22.58■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 KLRC3Q07444 240 aa22.58■■□□□ 1.21
SERBP1-201ENST00000361219 PTPN14Q15678 1187 aa22.58■■□□□ 1.21
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SERBP1-201ENST00000361219 ADSSL1Q8N142 457 aa22.58■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.58■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 CALML4Q96GE6 196 aa22.58■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
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SERBP1-201ENST00000361219 PSMD14O00487 310 aa22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 RAB34Q9BZG1 259 aa22.57■■□□□ 1.2
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SERBP1-201ENST00000361219 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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SERBP1-201ENST00000361219 PDIA5Q14554 519 aa22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 CEP135Q66GS9 1140 aa22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 TRIM9Q9C026 710 aa22.57■■□□□ 1.2
SERBP1-201ENST00000361219 VPS33BQ9H267 617 aa22.57■■□□□ 1.2
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