RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 DISC1Q9NRI5 854 aa24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM260Q9NX78 707 aa24.34■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 NDUFB10O96000 172 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 CUL5Q93034 780 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 IFNKQ9P0W0 207 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 RAD21O60216 631 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 TNNI2P48788 182 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 FANCCQ00597 558 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.33■■□□□ 1.49
SNRNP25-201ENST00000293861 MTRQ99707 1265 aa24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.32■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 UBA7P41226 1012 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K10Q02779 954 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 BMP3P12645 472 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 STAT6P42226 847 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 MTMR9Q96QG7 549 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CUEDC2Q9H467 287 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 FANCLQ9NW38 375 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.31■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CBFA2T2O43439 604 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 EDIL3O43854 480 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 MYL1P05976 194 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP1A3P13637 1013 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC25AP30304 524 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 DPF2Q92785 391 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.3■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1W2PRG0 241 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 SEMA3FQ13275 785 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 TNFAIP1Q13829 316 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 TMX2Q9Y320 296 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 FZD9O00144 591 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF18P17022 549 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CASP1P29466 404 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 GSDMDP57764 484 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.29■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PP2D1A8MPX8 630 aa24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CUL4BQ13620 913 aa24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 MED15Q96RN5 788 aa24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 GOPCQ9HD26 462 aa24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 RMND1Q9NWS8 449 aa24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa24.28■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 SHTN1A0MZ66 631 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 RASSF7Q02833 373 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 POTEDQ86YR6 584 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CAP2P40123 477 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 UBASH3AP57075 661 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 LRMPQ12912 555 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CABP7Q86V35 215 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 STAMQ92783 540 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 SH2D4AQ9H788 454 aa24.27■■□□□ 1.48
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM232C9JQI7 657 aa24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 SERPINC1P01008 464 aa24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 CALCRLQ16602 461 aa24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE2SQ16763 222 aa24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 MCTP2Q6DN12 878 aa24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 AMNQ9BXJ7 453 aa24.26■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 PDIA5Q14554 519 aa24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 RASA3Q14644 834 aa24.25■■□□□ 1.47
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms