RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 USP33Q8TEY7 942 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 CASP14P31944 242 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 EVA1CP58658 441 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 RPS6KA1Q15418 735 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 VSTM4Q8IW00 320 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 PLVAPQ9BX97 442 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ATP2A1O14983 1001 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 JAK2O60674 1132 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ATP1A3P13637 1013 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 KRT15P19012 456 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 HSPA1LP34931 641 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 USP14P54578 494 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ANO1Q5XXA6 986 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 MICU3Q86XE3 530 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 PARVBQ9HBI1 364 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 C2CD2Q9Y426 696 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 PLAAQ9Y263 795 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.66□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 APOEP02649 317 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 PDE6CP51160 858 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ME3Q16798 604 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ADALQ6DHV7 355 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 CEP85Q6P2H3 762 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 WAPLQ7Z5K2 1190 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ALDH1L1O75891 902 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 POTEJP0CG39 1038 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 UBA7P41226 1012 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM110Q86TL2 294 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 COQ7Q99807 217 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 SSH2Q76I76 1423 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.65□□□□□ -0.54
KPNA3-201ENST00000261667 RGS12O14924 1447 aa11.65□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 IQCB1Q15051 598 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 KIFAP3Q92845 792 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 RAB17Q9H0T7 212 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 DKK3Q9UBP4 350 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 GGT7Q9UJ14 662 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 PIK3R4Q99570 1358 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 CCDC189A1A4V9 331 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 FAM107AO95990 144 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 GSTA2P09210 222 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 CTNNA2P26232 953 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 NLRP6P59044 892 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 RILPQ96NA2 401 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 TMEM232C9JQI7 657 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 IKBKBO14920 756 aa11.64□□□□□ -0.55
KPNA3-201ENST00000261667 CHMP2AO43633 222 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms