RNA–Protein interactions for RNA: YPL204W

HRR25, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene HRR25, Length 1,485 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRR25	YPL204W	PPX1	P38698	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MUP3	P38734	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MEP1	P40260	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YTA6	P40328	754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	IRR1	P40541	1150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	AXL1	P40851	1208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YFR018C	P43599	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	SWC4	P53201	476 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	FRE4	P53746	719 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YNL165W	P53891	406 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	UBX4	P54730	416 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	TGL2	P54857	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	OSH6	Q02201	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	CSN9	Q03981	162 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MCD1	Q12158	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MDY2	Q12285	212 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	ICT1	Q12385	394 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	FAB1	P34756	2278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	RAD3	P06839	778 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	NMT1	P14743	455 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	EPT1	P22140	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	PHO3	P24031	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	ASK1	P35734	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	IML3	P38265	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	PIK1	P39104	1066 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	TIM17	P39515	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	ROM1	P53046	1155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MTO1	P53070	669 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YGL108C	P53139	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	VPS16	Q03308	798 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	TVP15	Q03860	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	SPO20	Q04359	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	SEC10	Q06245	871 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	OPI10	Q08202	246 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	UBX3	Q12229	455 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	HEM2	P05373	342 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	RHO2	P06781	192 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	VAN1	P23642	535 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	HCM1	P25364	564 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YSC84	P32793	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	THI80	P35202	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	LRG1	P35688	1017 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	EFM1	P38732	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	HSE1	P38753	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	PCL5	P38794	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	CCT6	P39079	546 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MRX1	P40050	688 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MAD3	P47074	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	COQ5	P49017	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	AIF1	P52923	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	CLD1	P53264	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	IBD2	P53892	351 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	AQR1	P53943	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	ARP4	P80428	489 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	GOT1	Q03554	138 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	CRN1	Q06440	651 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	GNT1	Q12096	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	STB3	Q12427	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YPT6	Q99260	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YPR089W	O13585	888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	SUC2	P00724	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MLF3	P32047	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	PTM1	P32857	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	SKT5	P34226	696 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YKL100C	P34248	587 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	GMH1	P36125	273 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
HRR25	YPL204W	GIP1	P38229	639 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	TAE1	P38340	232 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	HXT5	P38695	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	YHR045W	P38775	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	CYC2	P38909	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
HRR25	YPL204W	NNF1	P47149	201 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HRR25	YPL204W	NPY1	P53164	384 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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