RNA–Protein interactions for RNA: YPL157W

TGS1, Transcript of Trimethyl guanosine synthase, conserved nucleolar methyl transferase, yeast

Gene TGS1, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TGS1	YPL157W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MCM10	P32354	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MRX3	P38172	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RCY1	P39531	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PSF2	P40359	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CAB2	P40506	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SNL1	P40548	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	VPS64	Q03944	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RTP1	Q12751	981 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ABF1	P14164	731 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PCH2	P38126	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	UBS1	P38290	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	YHI9	P38765	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RRF1	P38771	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	FMP10	P40098	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	YER186C	P40101	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PCI8	P40512	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	BRO1	P48582	844 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SCS3	P53012	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MIG2	P53035	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	LIF1	P53150	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ATG4	P53867	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SLT2	Q00772	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	INA17	Q02888	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	FCP1	Q03254	732 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ARA2	Q04212	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RAD33	Q04231	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	AIM6	Q07716	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CTI6	Q08923	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	UIP4	Q08926	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	BUG1	Q12191	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	LYS2	P07702	1392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	KSS1	P14681	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	BET2	P20133	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	DBF2	P22204	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CNA1	P23287	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CLB2	P24869	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CNS1	P33313	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RRN3	P36070	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	YJL070C	P40361	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	YJR054W	P47114	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	KAP114	P53067	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	NMA2	P53204	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MEP3	P53390	489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	COA4	Q05809	96 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	NSE1	Q07913	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RKI1	Q12189	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SEY1	Q99287	776 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CTT1	P06115	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	RED1	P14291	827 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	VPS34	P22543	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	RXT2	P38255	430 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	JLP2	P40206	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	MIC19	P43594	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	IDS2	P46958	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	CTF18	P49956	741 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	MRM2	P53123	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	YGR067C	P53243	804 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	COG2	P53271	262 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	ZDS2	P54786	942 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	TAF11	Q04226	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	UFO1	Q04511	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	COX20	Q04935	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TGS1	YPL157W	VID22	Q05934	901 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.2 ms