RNA–Protein interactions for RNA: YOR106W

VAM3, Transcript of Syntaxin-like vacuolar t-SNARE, yeast

Gene VAM3, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAM3	YOR106W	GRC3	Q07845	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	CYB2	P00175	591 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	FUI1	P38196	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YML131W	Q03102	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	IOC4	Q04213	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	SKM1	Q12469	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RER1	P25560	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	LAG1	P38703	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YER130C	P39959	443 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RTS3	P53289	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	BSC5	P53755	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RSM23	Q01163	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	ENT4	Q07872	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	TEN1	Q07921	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	PPT2	Q12036	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	IKS1	P47042	667 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	VPS17	P32913	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YKL100C	P34248	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	MDM31	P38880	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RTS1	P38903	757 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YTA12	P40341	825 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	PTR3	P43606	678 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YGR127W	P53275	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RAD30	Q04049	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	RBA50	Q04418	439 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	SSP2	Q08646	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	SEC62	P21825	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	MAL33	P38157	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	SIP4	P46954	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	DUG3	P53871	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	DIC1	Q06143	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VAM3	YOR106W	MRS3	P10566	314 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	SAM50	P53969	484 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	DPB3	P27344	201 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	BUD14	P27637	709 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	ECM15	P35195	104 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	FAR3	P46671	204 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	RTT109	Q07794	436 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	CDC45	Q08032	650 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	THI20	Q08224	551 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	SDH5	Q08230	162 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	CPR3	P25719	182 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	ICS2	P38284	255 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	KRE9	P39005	276 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	AFG3	P39925	761 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	EFM6	P53970	246 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	GLO2	Q05584	274 aa		4.5	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	BOS1	P25385	244 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	IMG1	P25626	169 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	PTR2	P32901	601 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	RHO4	Q00246	291 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YSA1	Q01976	231 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YBL029W	P38201	376 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	RTT101	P47050	842 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	SHR3	Q02774	210 aa		4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YIH1	P25637	258 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	SYN8	P31377	255 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	NDC1	P32500	655 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	NUP133	P36161	1157 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YHR218W	P38899	603 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	SNG1	P46950	547 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	YML037C	Q03703	340 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	OPY2	Q06810	360 aa		4.47	□□□□□ -1.69
VAM3	YOR106W	SET6	Q12529	373 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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