RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	AMD2	P22580	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PPH22	P23595	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	DCC1	P25559	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	AAD3	P25612	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	KAR9	P32526	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CSE1	P33307	960 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PXA2	P34230	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SET3	P36124	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ETR1	P38071	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	APM3	P38153	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YBP1	P38315	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YJL206C	P39529	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CHS6	P40955	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SIP4	P46954	829 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TAH11	P47112	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TRS31	Q03337	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SFH1	Q06168	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	COX5A	P00424	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MRPL8	P22353	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CDC20	P26309	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TOM20	P35180	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	EXO1	P39875	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RGI2	P40188	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ELO3	P40319	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TEL2	P53038	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PEX8	P53248	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TIM13	P53299	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TEP1	P53916	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NHP10	Q03435	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TMN2	Q04562	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PEX15	Q08215	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TRE2	Q08693	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SPE4	Q12455	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RGS2	Q99188	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
TRM10	YOL093W	NMT1	P14743	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PMA2	P19657	947 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CLN1	P20437	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RBK1	P25332	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SGF29	P25554	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MSH1	P25846	959 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MSH2	P25847	964 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	DEP1	P31385	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PHA2	P32452	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TOA1	P32773	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CYM1	P32898	989 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MED6	P38782	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	STN1	P38960	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	TAF6	P53040	516 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SPC105	P53148	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	BIO4	P53630	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SHE9	Q04172	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ARP9	Q05123	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	VTA1	Q06263	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YET3	Q07451	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	FLC1	Q08967	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	OCA6	Q12454	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	SIR1	P21691	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	MNE1	P24720	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	CLB1	P24868	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	FUN30	P31380	1131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	RPC82	P32349	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	AEP1	P32493	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	STB6	P36085	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YSW1	P38280	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	HEM14	P40012	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	YJR061W	P40355	935 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TRM10	YOL093W	IME4	P41833	600 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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