RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	NKP1	Q12493	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	MHP1	P43638	1398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	TOP1	P04786	769 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	YKL050C	P35736	922 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	MIA40	P36046	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	NNF2	P53253	936 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	RAD30	Q04049	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	PSR1	Q07800	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	SRL1	Q08673	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	IML1	P47170	1584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PFA4	YOL003C	CDC16	P09798	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	SGF73	P53165	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	ESBP6	P53918	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	SNA4	Q07549	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	APL4	Q12028	832 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	CBP1	P07252	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	BUR6	P40096	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	PRE8	P23639	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YCR043C	P25361	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	CHS3	P29465	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	RTS1	P38903	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	PHO90	P39535	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YEL068C	P39977	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	SGM1	P47166	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YNL181W	P53878	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	KAR3	P17119	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	ADH7	P25377	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	PGS1	P25578	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	PAH1	P32567	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YPK3	P38070	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	AGP2	P38090	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	ELO1	P39540	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	VRG4	P40107	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	LYS14	P40971	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	DIA3	P52290	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	NUP53	Q03790	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	RTT109	Q07794	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	BUD7	Q08754	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	TCO89	Q08921	799 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	EDE1	P34216	1381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	NUP192	P47054	1683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	BNI1	P41832	1953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	SEM1	O94742	89 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	RPB8	P20436	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	SPE2	P21182	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	VMA16	P23968	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	MAL33	P38157	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	TSC10	P38342	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	EFM2	P38347	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YIL060W	P40519	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	BET4	Q00618	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	STV1	P37296	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	UBA4	P38820	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	EKI1	Q03764	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YCK1	P23291	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	MET30	P39014	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	RTS2	P40962	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	IAH1	P41734	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	PKP2	P53170	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YNL234W	P53857	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	RSF1	Q05043	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	SPE4	Q12455	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PFA4	YOL003C	GID7	P25569	745 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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