RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	PUT2	P07275	575 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	PHO81	P17442	1178 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	PSD1	P39006	500 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.61	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	PMR1	P13586	950 aa		3.6	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	IME4	P41833	600 aa		3.6	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	ARG81	P05085	880 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	MTF2	P10849	440 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	RAD16	P31244	790 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	HXT1	P32465	570 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	PMU1	P36069	295 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	TUL1	P36096	758 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	TSC10	P38342	320 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	DBP8	P38719	431 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	WSC2	P53832	503 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	CIA1	Q05583	330 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	NKP1	Q12493	238 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CSI1	YMR025W	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RER1	P25560	188 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	NPR2	P39923	615 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	CSM2	P40465	213 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	SMK1	P41808	388 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	SGM1	P47166	707 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RHO4	Q00246	291 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	TFC6	Q06339	672 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	MSM1	P22438	575 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	YCR022C	P25620	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	ACA1	P39970	489 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	BUR6	P40096	142 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	VPS4	P52917	437 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	GLO2	Q05584	274 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	HNT3	Q08702	217 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	LSB5	P25369	354 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	INN1	P53901	409 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	ECM30	Q06673	1274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	NUS1	Q12063	375 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	ATP4	P05626	244 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	ATR1	P13090	542 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	APE1	P14904	514 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	GRX7	P38068	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RSM23	Q01163	450 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	SRO77	P38163	1010 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	ELO1	P39540	310 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	INA17	Q02888	182 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	SYO1	Q07395	620 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	SHO1	P40073	367 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	RTT109	Q07794	436 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	ENT4	Q07872	247 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSI1	YMR025W	YLR302C	O13544	120 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SDT1	P53078	280 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	MUB1	Q03162	620 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	BLS1	Q06071	122 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	NAM9	P27929	486 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	ALG8	P40351	577 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	BTN2	P53286	410 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	APJ1	P53940	528 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	MHR1	Q06630	226 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	TEN1	Q07921	160 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	NYV1	Q12255	253 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.5	□□□□□ -1.85	not detected
CSI1	YMR025W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	MSN2	P33748	704 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	RIC1	P40395	1056 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	DIA3	P52290	468 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CSI1	YMR025W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85

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