RNA–Protein interactions for RNA: YJL109C

UTP10, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP10, Length 5,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP10	YJL109C	PER33	Q12144	273 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YLR122C	Q12312	125 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YOL114C	Q12322	202 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SUL2	Q12325	893 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	BBP1	Q12365	385 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SPE4	Q12455	300 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DIF1	O13577	133 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YML002W	P0CF17	737 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YFL068W	P0CX99	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CBS2	P14905	389 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	STE4	P18851	423 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ADP1	P25371	1049 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SGF29	P25554	259 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YCR051W	P25631	222 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YIH1	P25637	258 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	URK1	P27515	501 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RAD14	P28519	371 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CHS3	P29465	1165 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DBF20	P32328	564 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GSH1	P32477	678 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SHP1	P34223	423 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YKL069W	P36088	180 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	APL3	P38065	1025 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RIB5	P38145	238 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	UBP13	P38187	747 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	FMP23	P38231	175 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TAE1	P38340	232 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YHR112C	P38716	378 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PEX18	P38855	283 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SUR2	P38992	349 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PES4	P39684	611 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	NPP2	P39997	493 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SCC4	P40090	624 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YJL070C	P40361	888 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	KTR7	P40504	517 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	IMA5	P40884	581 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PAC11	P40960	533 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SAD1	P43589	448 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	JAC1	P53193	184 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YGR125W	P53273	1036 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YGR266W	P53326	701 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YNL144C	P53907	740 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	NUP116	Q02630	1113 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	VPS30	Q02948	557 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YPL034W	Q03083	165 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	HRD3	Q05787	833 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MDM30	Q05930	598 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YLR407W	Q06070	228 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SEC10	Q06245	871 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	LOT6	Q07923	191 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SMC5	Q08204	1093 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SRO7	Q12038	1033 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PUS9	Q12069	462 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ACF2	Q12168	779 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
UTP10	YJL109C	SUT2	Q12286	268 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SFM1	Q12314	213 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YDR262W	Q12331	272 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	LAG2	Q92325	660 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RAD61	Q99359	647 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	COX2	P00410	251 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	BI4	P03879	638 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PRB1	P09232	635 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PET122	P10355	254 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MET8	P15807	274 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TUP1	P16649	713 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	EXO70	P19658	623 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	VPS3	P23643	1011 aa		0.58	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PHO3	P24031	467 aa		0.58	□□□□□ -2.32

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