RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PMT1P33775 817 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ASK1P35734 292 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W CMC1P36064 111 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ADE17P38009 592 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W CAJ1P39101 391 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W UIP3P39547 235 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PHM8P40025 321 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YFR020WP43600 232 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YJL043WP47053 257 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W TWF1P53250 332 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W BOP3P53958 396 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RSC9Q03124 581 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W HRD3Q05787 833 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RLM1Q12224 676 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W AFI1Q99222 893 aa3.56□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W APE1P14904 514 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.55□□□□□ -1.84not detected
SNX4YJL036W PTC6P25646 442 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SYN8P31377 255 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W EXO1P39875 702 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SEC28P40509 296 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PKP1P40530 394 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W OPT1P40897 799 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W HXT14P42833 540 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YFL015CP43578 164 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W FAR3P46671 204 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YGR127WP53275 312 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ROY1Q04847 553 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W HIF1Q12373 385 aa3.55□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RTC1Q08281 1341 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MRP13P12686 339 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SPE2P21182 396 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W URE2P23202 354 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W IMG1P25626 169 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YME1P32795 747 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MRE11P32829 692 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YBR144CP34215 104 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YKL100CP34248 587 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PXL1P36166 706 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PTR3P43606 678 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W EFM6P53970 246 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W OAZ1Q02803 292 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PEX25Q02969 394 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W FIN1Q03898 291 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W FMP45Q07651 309 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ATG9Q12142 997 aa3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W PET111P08468 800 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W GSY2P27472 705 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W URA7P28274 579 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W GSH1P32477 678 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ICS2P38284 255 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W ELO1P39540 310 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data3.53□□□□□ -1.84not detected
SNX4YJL036W RPN11P43588 306 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YDR286CQ05530 114 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W BSP1Q06604 576 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W CYK3Q07533 885 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W YOR389WQ08912 624 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W SEC39Q12745 709 aa3.53□□□□□ -1.84
SNX4YJL036W TPM1P17536 199 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CLC1P17891 233 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ART10P18634 518 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W PRD1P25375 712 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W PUP3P25451 205 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W TCB2P48231 1178 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.52□□□□□ -1.85not detected
SNX4YJL036W KAP120Q02932 1032 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W PDS5Q04264 1277 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W VTA1Q06263 330 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W TEN1Q07921 160 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W APL4Q12028 832 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W GPM3Q12326 303 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W ISN1Q99312 450 aa3.52□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W BI2P03873 423 aa3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SNX4YJL036W RAP1P11938 827 aa3.51□□□□□ -1.85
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