RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	RGS2	Q99188	309 aa		5	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YCL068C	P25593	260 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TRM5	P38793	499 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YDR089W	P38966	869 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SEO1	P39709	593 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YGL108C	P53139	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	GGA1	Q06336	557 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	OPT2	Q06593	877 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TGL5	Q12043	749 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	INH1	P01097	85 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	MRPL9	P31334	269 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	CYM1	P32898	989 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PEX5	P35056	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YKR015C	P36111	568 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	LDB7	P38210	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	IML3	P38265	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	NHX1	Q04121	633 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RSC2	Q06488	889 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	NKP1	Q12493	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RMD5	Q12508	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TEL1	P38110	2787 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SNT1	P25357	1226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	MRP21	P38175	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YJL206C	P39529	758 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	MEF2	P39677	819 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SUN4	P53616	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	EAF1	Q06337	982 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	EPT1	P22140	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PHO87	P25360	923 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PHA2	P32452	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	LHS1	P36016	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PHO89	P38361	574 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	DBP8	P38719	431 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	BZZ1	P38822	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	COG2	P53271	262 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PET117	Q02771	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ARG7	Q04728	441 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ATR1	P13090	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SNF5	P18480	905 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SAN1	P22470	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ECM4	P36156	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PCL5	P38794	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	CYC2	P38909	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	FAA3	P39002	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	CCT6	P39079	546 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	ALG8	P40351	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	GTS1	P40956	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	BUD32	P53323	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TGL2	P54857	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	BUD7	Q08754	746 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	VPS68	Q12016	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	GDA1	P32621	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	LTP1	P40347	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	IRR1	P40541	1150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SNL1	P40548	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	IME4	P41833	600 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	CIS3	P47001	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	PEX8	P53248	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	HST2	P53686	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SRL4	Q03085	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	EMI1	Q04406	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	CDC123	Q05791	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
MSH1	YHR120W	TFB4	Q12004	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	TRM8	Q12009	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	YPR089W	O13585	888 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	SPS1	P08458	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSH1	YHR120W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
MSH1	YHR120W	BEM1	P29366	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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