RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C PRM2P40534 656 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YFL040WP43562 540 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SLD3P53135 668 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C TOF2Q02208 771 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C TLG1Q03322 224 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C NHP10Q03435 203 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RSN1Q03516 953 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C GAS3Q03655 524 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C PLP1Q04004 230 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C ARP10Q04549 284 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YDR109CQ04585 715 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YMR321CQ04898 105 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C ARR1Q06596 294 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SGO1Q08490 590 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C MED2Q12124 431 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C REC8Q12188 680 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C MDY2Q12285 212 aa5.3□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C THP2O13539 261 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RPN13O13563 156 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C MET17P06106 444 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C GPH1P06738 902 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C HMG2P12684 1045 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C GLN3P18494 730 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SDH2P21801 266 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YSP3P25036 478 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C PUP3P25451 205 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C DUR3P33413 735 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C HSP78P33416 811 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SPC34P36131 295 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C AGP2P38090 596 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YBR139WP38109 508 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YBL029WP38201 376 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C FMP23P38231 175 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YBR053CP38235 358 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C FSH1P38777 243 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SFB3P38810 929 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C AST2P39945 430 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RRD1P40454 393 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SER33P40510 469 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YJL049WP47048 450 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C NAS6P50086 228 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C LSG1P53145 640 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C PEX8P53248 589 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YNR068CP53754 272 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C CWC24P53769 259 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RMI1Q02685 241 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C FMP30Q02883 468 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C CDD1Q06549 142 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YPL247CQ12523 523 aa5.29□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C UBR2Q07963 1872 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C LAA1P39526 2014 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RPL6BP05739 176 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SWI5P08153 709 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C GAC1P28006 793 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C PRP19P32523 503 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C MRP21P38175 177 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C SHE3P38272 425 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C FAD1P38913 306 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RPS26AP39938 119 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RPS26BP39939 119 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YEL028WP39989 153 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YER186CP40101 306 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C JLP2P40206 208 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C ATM1P40416 690 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C IMD3P50095 523 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C YGR053CP53234 283 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C ALG11P53954 548 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C KTR6P54070 446 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C TRM12Q04235 462 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C BRE4Q07660 1125 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C GPM2Q12008 311 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C RIB3Q99258 208 aa5.28□□□□□ -1.56
SSZ1YHR064C TRP3P00937 484 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CDC31P06704 161 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MRP13P12686 339 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ART10P18634 518 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SGF29P25554 259 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C EMC1P25574 760 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CYS3P31373 394 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FUN30P31380 1131 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HBS1P32769 611 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C AIM26P32858 118 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RGT1P32862 1170 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MRPL6P32904 214 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PTH2P34222 208 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GIP4P39732 760 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PSF2P40359 213 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MAF1P41910 395 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms