RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W DHH1P39517 506 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W RIM8P53179 542 aa8.77□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YLR111WQ12528 110 aa8.77□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W PHO5P00635 467 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YAR066WP0CX18 203 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YHR214WP0CX19 203 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W TYR1P20049 452 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W ATP12P22135 325 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W NIP1P32497 812 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W THI80P35202 319 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W LRG1P35688 1017 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W SEC9P40357 651 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YFR020WP43600 232 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W NNF2P53253 936 aa8.76□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W NAR1P23503 491 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W PHO3P24031 467 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W URA10P30402 227 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W PRO1P32264 428 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W SFA1P32771 386 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W STO1P34160 861 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W DMA1P38823 416 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W GAT1P43574 510 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YFL012WP43580 148 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W RPC17P47076 161 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W GCV1P48015 400 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W FHN1P53279 174 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W ADE12P80210 433 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W SED5Q01590 340 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W GAD1Q04792 585 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W TEN1Q07921 160 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W NUS1Q12063 375 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W ZRT2Q12436 422 aa8.75□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CLN2P20438 545 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W MGT1P26188 188 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W EHT1P38295 451 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W MPS2P53159 387 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W ERG26P53199 349 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W EAF7P53911 425 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W AAT1Q01802 451 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W SPP2Q02521 185 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W HAL9Q12180 1030 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YOR114WQ12219 294 aa8.74□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YPT1P01123 206 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CDC9P04819 755 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W MET8P15807 274 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data8.73□□□□□ -1.01not detected
CPD1YGR247W GCD6P32501 712 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W SRB5P32585 307 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data8.73□□□□□ -1.01not detected
CPD1YGR247W VHC1P38329 1120 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W RGA1P39083 1007 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W MEP1P40260 492 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W IBA57P47158 497 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CWC22P53333 577 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W GIC2Q06648 383 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W VAC14Q06708 880 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W SYT1Q06836 1226 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YDR056CQ12025 205 aa8.73□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CYT1P07143 309 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W ARG1P22768 420 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CPR3P25719 182 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CDC20P26309 610 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W HRR25P29295 494 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W LST4P34239 828 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CAB3P36076 571 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data8.72□□□□□ -1.01not detected
CPD1YGR247W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W MRS2Q01926 470 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W TPP1Q03796 238 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W ECI1Q05871 280 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W MDM30Q05930 598 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W FMP45Q07651 309 aa8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CPD1YGR247W YML002WP0CF17 737 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W CDC26P14724 124 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W MNN1P39106 762 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W HAT2P39984 401 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W YET2Q04210 160 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W DFG5Q05031 458 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W ATG29Q12092 213 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W ICT1Q12385 394 aa8.71□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W STE2D6VTK4 431 aa8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W COX1P00401 534 aa8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W URA7P28274 579 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W KAE1P36132 386 aa8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W SOL2P37262 315 aa8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W YHI9P38765 294 aa8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W MNL1P38888 796 aa8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W SEC24P40482 926 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W YGR012WP53206 393 aa8.7□□□□□ -1.02
CPD1YGR247W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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