RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	CCE1	Q03702	353 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	RCO1	Q04779	684 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ARP9	Q05123	467 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TMA16	Q08687	178 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MDM35	O60200	86 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YSP3	P25036	478 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NFS1	P25374	497 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	CPR3	P25719	182 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MRPL15	P36523	253 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	PSY4	P38193	441 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	TRM9	P49957	279 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ECM9	Q02202	377 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ROT1	Q03691	256 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	IVY1	Q04934	453 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MSP1	P28737	362 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MRPL9	P31334	269 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	CTF13	P35203	478 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	RGI2	P40188	164 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YIL086C	P40503	102 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MON1	P53129	644 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ZRG17	P53735	605 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	REH1	Q06709	432 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YLR001C	Q07895	862 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	AVO1	Q08236	1176 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	HUA2	Q12134	243 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MCD1	Q12158	566 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	HOM3	P10869	527 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YAT2	P40017	923 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SER3	P40054	469 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	PHB1	P40961	287 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YFR020W	P43600	232 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YGR045C	P53229	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SIW14	P53965	281 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NUP100	Q02629	959 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YET2	Q04210	160 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GAD1	Q04792	585 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YDR338C	Q05497	695 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MDM30	Q05930	598 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	THI7	Q05998	598 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ESC2	Q06340	456 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NRT1	Q08485	598 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YVC1	Q12324	675 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SEC65	P29478	273 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GIC1	P38785	314 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ERP5	P38819	212 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	FLC2	P39719	783 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	VFA1	P40080	203 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YIR014W	P40570	242 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MET14	Q02196	202 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	UME1	Q03010	460 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NGL3	Q03210	505 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SSY1	Q03770	852 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	RAX1	Q08760	435 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	LAG2	Q92325	660 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	SEM1	O94742	89 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	PRO1	P32264	428 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	DBF4	P32325	704 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	NNK1	P36003	928 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MOH1	P38191	138 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GPI16	P38875	610 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	MDJ2	P42834	146 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	RPC17	P47076	161 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	ATG16	Q03818	150 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	YDL218W	Q07629	317 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SYF2	YGR129W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

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