RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	VPS54	Q12071	889 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	HUA2	Q12134	243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SKM1	Q12469	655 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	APE1	P14904	514 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ITR1	P30605	584 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	EFM2	P38347	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	STB5	P38699	743 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MRX1	P40050	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YFL015C	P43578	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	LCL3	P53153	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	AAD4	Q07747	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CRT10	Q08226	957 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RBD2	Q12270	262 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	GAL7	P08431	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CLB3	P24870	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CLB4	P24871	460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	HEL1	P36113	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	STV1	P37296	890 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	IFA38	P38286	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TCD1	P38756	429 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	VFA1	P40080	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YIL089W	P40500	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	OPT1	P40897	799 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TDA10	P42938	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	IDS2	P46958	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	LOT6	Q07923	191 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	NBP2	Q12163	236 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	GRX6	Q12438	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YCR061W	P25639	631 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	BUD2	P33314	1104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MMS4	P38257	691 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RFC3	P38629	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	EFM4	P40516	257 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ASE1	P50275	885 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	SEG1	Q04279	960 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MSC3	Q05812	728 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	BOP2	Q06150	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CTI6	Q08923	506 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RCN2	Q12044	265 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	AVL9	Q12500	764 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CPR2	P23285	205 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	HIR2	P32480	875 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RPC34	P32910	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	HOT13	P36078	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YHR054C	P38780	354 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	STN1	P38960	494 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	FLC2	P39719	783 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YJR061W	P40355	935 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MET18	P40469	1032 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YRB2	P40517	327 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	TAX4	P47030	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MRX6	P48564	524 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	ACS1	Q01574	713 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YML122C	Q03207	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	WAR1	Q03631	944 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	BCP1	Q06338	283 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	GPM3	Q12326	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ACT1	YFL039C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MBR1	P23493	339 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	GSY2	P27472	705 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	PTR2	P32901	601 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	MSN4	P33749	630 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ACT1	YFL039C	SIP3	P38717	1229 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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