RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W PCL5P38794 229 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W BZZ1P38822 633 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W IRR1P40541 1150 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W VMA13P41807 478 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W YJR154WP47181 346 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W COG7P53195 279 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W CLD1P53264 445 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W IBD2P53892 351 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W GTR1Q00582 310 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W NHP10Q03435 203 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W FAR10Q06001 478 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W VAM6Q07468 1049 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W TGL5Q12043 749 aa8.78□□□□□ -1
DDI1YER143W SBP1P10080 294 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NMT1P14743 455 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SLY41P22215 453 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RAD14P28519 371 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W TOA1P32773 286 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NUP120P35729 1037 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W TSC10P38342 320 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SHU2P38957 223 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W STB2P46679 850 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W USE1P53146 245 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W KXD1P53158 218 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SWC4P53201 476 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NMA2P53204 395 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YNR061CP53747 219 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.77□□□□□ -1.01not detected
DDI1YER143W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RIF2Q06208 395 aa8.77□□□□□ -1.01
DDI1YER143W HEM2P05373 342 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W ART10P18634 518 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W VAN1P23642 535 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GFD2P25370 566 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SPR1P32603 445 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W IML3P38265 245 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W MEP1P40260 492 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NPY1P53164 384 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NNF2P53253 936 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YML131WQ03102 365 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GPB1Q08886 897 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YOR012WQ12351 137 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GTT2Q12390 233 aa8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CAR1P00812 333 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RNA1P11745 407 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W EPT1P22140 391 aa8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RFA2P26754 273 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NUP84P52891 726 aa8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W EFM5P53200 248 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SHY1P53266 389 aa8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data8.75□□□□□ -1.01not detected
DDI1YER143W VTA1Q06263 330 aa8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YEH2Q07950 538 aa8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W ESA1Q08649 445 aa8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GNT1Q12096 491 aa8.75□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YMR084WA2P2R3 262 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SPT3P06844 337 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YAR066WP0CX18 203 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YHR214WP0CX19 203 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W FUS1P11710 512 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GUK1P15454 187 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CUE2P36075 443 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W ARN1P38731 627 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SSN3P39073 555 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W DHH1P39517 506 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W FRT2P39734 528 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GTR2P53290 341 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W AQR1P53943 586 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YET2Q04210 160 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GTB1Q04924 702 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YPR084WQ06821 456 aa8.74□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CET1O13297 549 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YSR3P23501 404 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W PHO84P25297 587 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W PTH2P34222 208 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W PTC1P35182 281 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GMH1P36125 273 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YHL008CP38750 627 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CYC2P38909 366 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W GDH3P39708 457 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YRB1P41920 201 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W MIG2P53035 382 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W LGE1Q02796 332 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YDL121CQ07541 149 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W YPR202WQ08993 238 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W PST1Q12355 444 aa8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
DDI1YER143W SUC2P00724 532 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18 ms