RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W SPO77Q06134 477 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YCG1Q06680 1035 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YDL114WQ07530 308 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YLR125WQ12138 136 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W NYV1Q12255 253 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RTR2Q12378 196 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HMS1Q12398 434 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SET6Q12529 373 aa3.45□□□□□ -1.86
VFA1YER128W LAM4P38800 1345 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SIR4P11978 1358 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W BIK1P11709 440 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W FUS3P16892 353 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SPS22P25380 463 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CDC15P27636 974 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W DPH2P32461 534 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PDB1P32473 366 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W UGP1P32861 499 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W VPS17P32913 551 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W NUP133P36161 1157 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W BMT2P38278 337 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W FTH1P38310 465 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SUR2P38992 349 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W VPS8P39702 1274 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CIR1P42940 261 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MNT2P53059 558 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TOF1P53840 1238 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W UBX4P54730 416 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W REC102Q02721 264 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TFB2Q02939 513 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HER2Q03557 464 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TDA9Q04545 1251 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YFT2Q06676 274 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YPR091CQ06833 770 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PSR2Q07949 397 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YEH2Q07950 538 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W NTG2Q08214 380 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SDH5Q08230 162 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W UIP4Q08926 304 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W TAH18Q12181 623 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W OCA6Q12454 224 aa3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
VFA1YER128W NUP159P40477 1460 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RAD1P06777 1100 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W WHI2P12611 486 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ABF1P14164 731 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SEC63P14906 663 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MET8P15807 274 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CNA1P23287 553 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RAD57P25301 460 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PRD1P25375 712 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HXT3P32466 567 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CBF2P32504 956 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W VAM7P32912 316 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MRPL37P36532 105 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YMC2P38087 329 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YER184CP39961 794 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W GIM4P40005 111 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W GET2P40056 285 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SLM1P40485 686 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ELP2P42935 788 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W UPF3P48412 387 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W HSH155P49955 971 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MRM2P53123 320 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RPN14P53196 417 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YGR151CP53287 111 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W PPM1Q04081 328 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W COA4Q05809 96 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MLC2Q06580 163 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SIL1Q08199 421 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YDL109CQ12103 647 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CAT8P39113 1433 aa3.43□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MDS3P53094 1487 aa3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W CKI1P20485 582 aa3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W IME1P21190 360 aa3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W RPI1P23250 407 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
VFA1YER128W SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
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