RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	ORC5	P50874	479 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YPR003C	P53394	754 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	BUD7	Q08754	746 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ATG29	Q12092	213 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	UBX3	Q12229	455 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	AVL9	Q12500	764 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	PCT1	P13259	424 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ADK2	P26364	225 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	AFG3	P39925	761 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CTK2	P46962	323 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SMC3	P47037	1230 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	DIA3	P52290	468 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	TWF1	P53250	332 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YGR127W	P53275	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	RSM28	Q03430	361 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	VPS38	Q05919	439 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	RRI1	Q12468	440 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SPT7	P35177	1332 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SYN8	P31377	255 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MRE11	P32829	692 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SEC66	P33754	206 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SEF1	P34228	1148 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	YKL100C	P34248	587 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	CMC1	P36064	111 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	ECM10	P39987	644 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SSU1	P41930	458 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	EFM6	P53970	246 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MAK10	Q02197	733 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	PIG1	Q06216	648 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	THI3	Q07471	609 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	INP53	Q12271	1107 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SEC39	Q12745	709 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AIM4	YBR194W	SPE2	P21182	396 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	GPI10	P30777	616 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	OCT1	P35999	772 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	BUR6	P40096	142 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	ALG5	P40350	334 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
AIM4	YBR194W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	VTA1	Q06263	330 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	SNA4	Q07549	140 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	MLH2	Q07980	695 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
AIM4	YBR194W	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.08	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	GAL80	P04387	435 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	CLB1	P24868	471 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	STE50	P25344	346 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	YCR043C	P25361	127 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	PRD1	P25375	712 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	YCR051W	P25631	222 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	PUP2	P32379	260 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	ANP1	P32629	500 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	SAS3	P34218	831 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	GCS1	P35197	352 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	STB6	P36085	766 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	CAJ1	P39101	391 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	DOT5	P40553	215 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	YIR016W	P40572	265 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	PET130	P47065	347 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	LCL3	P53153	274 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	SGF73	P53165	657 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	PDR8	Q06149	701 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	NDD1	Q08887	554 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	ATG9	Q12142	997 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AIM4	YBR194W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
AIM4	YBR194W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92

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