RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	STX6	O43752	255 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	FGR	P09769	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SHMT1	P34896	483 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	RTP1	P59025	263 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PPARA	Q07869	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	GBF1	Q92538	1859 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SYT1	P21579	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CNGA1	P29973	690 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ANTXR2	P58335	489 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SNX17	Q15036	470 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	NID2	Q14112	1375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PRKAB2	O43741	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ORC4	O43929	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	USP5	P45974	858 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PLCD1	P51178	756 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	EVX2	Q03828	476 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	GABPA	Q06546	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ESR2	Q92731	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131		A0A1W2PRG0	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CDKL5	O76039	1030 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ADORA2A	P29274	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SCRN1	Q12765	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PKP1	Q13835	747 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SHH	Q15465	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	NEDD4	P46934	1319 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-223	ENST00000524131	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	ERICH2	A1L162	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131		B4E1Z4	1266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	SEPT4	O43236	478 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	F13A1	P00488	732 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	SEPT2	Q15019	361 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	TCHH	Q07283	1943 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	STRN	O43815	780 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	TRAK2	O60296	914 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	COBL	O75128	1261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	ERCC3	P19447	782 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	PDE4B	Q07343	736 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-223	ENST00000524131	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms