RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 TMTC2Q8N394 836 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 MMP19Q99542 508 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC69A6NI79 296 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 TRIB2Q92519 343 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRN-216ENST00000486480 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.33■■□□□ 1.17
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PTPRN-216ENST00000486480 KLRF2D3W0D1 207 aa22.32■■□□□ 1.16
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PTPRN-216ENST00000486480 HOXC6P09630 235 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CPA1P15085 419 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 KCTD2Q14681 263 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CHST13Q8NET6 341 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 MYL10Q9BUA6 226 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO40Q9UH90 709 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 HMGCRP04035 888 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 INHAP05111 366 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 TKFCQ3LXA3 575 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
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PTPRN-216ENST00000486480 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 RNF146Q9NTX7 359 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 COBLO75128 1261 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CAPN15O75808 1086 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 ALAS1P13196 640 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 PSMA5P28066 241 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CCL14Q16627 93 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 DPP9Q86TI2 863 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K14Q99558 947 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 ACAD9Q9H845 621 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 LCTP09848 1927 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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PTPRN-216ENST00000486480 UBXN2AP68543 259 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 C8orf34Q49A92 452 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 PNMA2Q9UL42 364 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 SEC24BO95487 1268 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRN-216ENST00000486480 CALM1P0DP23 149 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CALM2P0DP24 149 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CALM3P0DP25 149 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 KIF5BP33176 963 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 MTFR1Q15390 333 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 APOA5Q6Q788 366 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 CENPFP49454 3210 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 RXRAP19793 462 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 FGD1P98174 961 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM32Q13049 653 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 MICU3Q86XE3 530 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.27■■□□□ 1.16
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PTPRN-216ENST00000486480 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN-216ENST00000486480 MCM3APO60318 1980 aa22.27■■□□□ 1.15
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PTPRN-216ENST00000486480 SOX10P56693 466 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 Q6ZUG5 572 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 MTMR8Q96EF0 704 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 MAML3Q96JK9 1138 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 CYTH3O43739 400 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 ANAPC15P60006 121 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 USH1GQ495M9 461 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN-216ENST00000486480 IFFO2Q5TF58 517 aa22.25■■□□□ 1.15
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