RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 ALAS1P13196 640 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF20Q5VTR2 975 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC27A2O14975 620 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 CNGA1P29973 690 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP2C19P33261 490 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 NECTIN1Q15223 517 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC23AQ15436 765 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 MAML3Q96JK9 1138 aa22.56■■□□□ 1.2
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SH3BP4-209ENST00000484097 ACAD9Q9H845 621 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF536O15090 1300 aa22.56■■□□□ 1.2
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SH3BP4-209ENST00000484097 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 CHST3Q7LGC8 479 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 SHISA4Q96DD7 197 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF146Q9NTX7 359 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 PNMA2Q9UL42 364 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ICAM1P05362 532 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
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SH3BP4-209ENST00000484097 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.53■■□□□ 1.2
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SH3BP4-209ENST00000484097 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-209ENST00000484097 MCM5P33992 734 aa22.52■■□□□ 1.2
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SH3BP4-209ENST00000484097 MSCO60682 206 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 MTA3Q9BTC8 594 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 POTEB2H3BUK9 544 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 PRC1O43663 620 aa22.5■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 CYBAP13498 195 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.5■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM87BQ96K49 555 aa22.49■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 SEPT4O43236 478 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT32Q14532 448 aa22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 SENP2Q9HC62 589 aa22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CNTN2Q02246 1040 aa22.46■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 USH1GQ495M9 461 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.46■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.46■■□□□ 1.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 DPF3Q92784 378 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-209ENST00000484097 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.45■■□□□ 1.18
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