RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.524e-14■■■□□ 15.2
ACTB-211ENST00000480301 SENP2Q9HC62 589 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 SGPL1O95470 568 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 DEFB118Q96PH6 123 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 FBXO40Q9UH90 709 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 BRCA2P51587 3418 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 TKFCQ3LXA3 575 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 MAML3Q96JK9 1138 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 CPVLQ9H3G5 476 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 ERICH2A1L162 156 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 ICAM1P05362 532 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 CYP2C19P33261 490 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 WTAPQ15007 396 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 ALAS1P13196 640 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 RNF20Q5VTR2 975 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 RASEFQ8IZ41 740 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 DDX11Q96FC9 970 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 MTA3Q9BTC8 594 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 ACAD9Q9H845 621 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 RNF146Q9NTX7 359 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 PRC1O43663 620 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 MCM5P33992 734 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TRPV1Q8NER1 839 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TROAPQ12815 778 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 KCNB2Q92953 911 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 LY9Q9HBG7 655 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 CYBAP13498 195 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 CAPN2P17655 700 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 TINF2Q9BSI4 451 aa24.46■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ACTB-211ENST00000480301 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 GRM4Q14833 912 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 LHX8Q68G74 356 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 TMEM87BQ96K49 555 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 FGD4Q96M96 766 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 NEK1Q96PY6 1258 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.45■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 KLRF2D3W0D1 207 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 REC8O95072 547 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 HSPA4P34932 840 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 PNMA2Q9UL42 364 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 LIFRP42702 1097 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 CNTN2Q02246 1040 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 TMTC2Q8N394 836 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.43■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 PFASO15067 1338 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 POTEB2H3BUK9 544 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 CNGA1P29973 690 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 KRT32Q14532 448 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.42■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 NFIBO00712 420 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 NSMFQ6X4W1 530 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms