RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438219.1

HCFC1-AS1-201, HCFC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCFC1-AS1, Length 350 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CPVLQ9H3G5 476 aa16.74■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHMLP26374 656 aa16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 OAZ1P54368 228 aa16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHST13Q8NET6 341 aa16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CEP290O15078 2479 aa16.73■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DNM1LO00429 736 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PDHBP11177 359 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PTH1RQ03431 593 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LRRC41Q15345 812 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARRDC4Q8NCT1 418 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PRO3102Q9H379 93 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ACAD9Q9H845 621 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FBXO40Q9UH90 709 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.72■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 POTEB2H3BUK9 544 aa16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PLA2G6O60733 806 aa16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RARBP10826 455 aa16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NSMFQ6X4W1 530 aa16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TAF6LQ9Y6J9 622 aa16.71■□□□□ 0.27
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KBTBD13C9JR72 458 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FDX1P10109 184 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PTGS1P23219 599 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF543Q08ER8 600 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARMCX2Q7L311 632 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TTC14Q96N46 770 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.7■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MYADML2A6NDP7 307 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ADCY6O43306 1168 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ICAM1P05362 532 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AKR1A1P14550 325 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RTP1P59025 263 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ACVR2BQ13705 512 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NRBP1Q9UHY1 535 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ASTN1O14525 1302 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.69■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NFIBO00712 420 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SNHG28P0DPA3 235 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TKFCQ3LXA3 575 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRIM60Q495X7 471 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DGKHQ86XP1 1220 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PNMA1Q8ND90 353 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GDF15Q99988 308 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KAT14Q9H8E8 782 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PARP14Q460N5 1801 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TNKSO95271 1327 aa16.68■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IQCA1Q86XH1 822 aa16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KATNBL1Q9H079 304 aa16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.67■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SGSM2O43147 1006 aa16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ADAMTS4O75173 837 aa16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CYP21A2P08686 494 aa16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CALML3P27482 149 aa16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 USH1GQ495M9 461 aa16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CHST3Q7LGC8 479 aa16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RNF180Q86T96 592 aa16.66■□□□□ 0.26
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms