RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEFB118Q96PH6 123 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP2C19P33261 490 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPVLQ9H3G5 476 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SGPL1O95470 568 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHST13Q8NET6 341 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAML3Q96JK9 1138 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO40Q9UH90 709 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ICAM1P05362 532 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RASEFQ8IZ41 740 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPV1Q8NER1 839 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF146Q9NTX7 359 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALAS1P13196 640 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TKFCQ3LXA3 575 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERICH2A1L162 156 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRC1O43663 620 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WTAPQ15007 396 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX11Q96FC9 970 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACAD9Q9H845 621 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF20Q5VTR2 975 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LY9Q9HBG7 655 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYBAP13498 195 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCM5P33992 734 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TROAPQ12815 778 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LHX8Q68G74 356 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGD4Q96M96 766 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TINF2Q9BSI4 451 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRM4Q14833 912 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNB2Q92953 911 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTA3Q9BTC8 594 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNTN2Q02246 1040 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLRF2D3W0D1 207 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM133AQ8N9E0 248 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM87BQ96K49 555 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEK1Q96PY6 1258 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFIBO00712 420 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSPA4P34932 840 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POTEB2H3BUK9 544 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAPN2P17655 700 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNGA1P29973 690 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYL10Q9BUA6 226 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 REC8O95072 547 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
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