RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CYP2C19P33261 490 aa31.61■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 DEFB118Q96PH6 123 aa31.61■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 GJA8P48165 433 aa31.6■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 RASEFQ8IZ41 740 aa31.6■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 RPTORQ8N122 1335 aa31.59■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF792Q3KQV3 632 aa31.59■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa31.59■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 MAML3Q96JK9 1138 aa31.59■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 RNF146Q9NTX7 359 aa31.59■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 ALAS1P13196 640 aa31.58■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM67Q5HYA8 995 aa31.58■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 CCPG1Q9ULG6 757 aa31.58■■■□□ 2.65
TPGS1-201ENST00000359315 PRC1O43663 620 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 WTAPQ15007 396 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 MUM1L1Q5H9M0 696 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 MFSD14CQ5VZR4 134 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 OLFML2BQ68BL8 750 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 STAG2Q8N3U4 1231 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 TRPV1Q8NER1 839 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 CHST13Q8NET6 341 aa31.57■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa31.56■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 SGPL1O95470 568 aa31.56■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 ICAM1P05362 532 aa31.56■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 ASPRV1Q53RT3 343 aa31.56■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 ERICH2A1L162 156 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 ADCK5Q3MIX3 580 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 FGD4Q96M96 766 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 TRERF1Q96PN7 1200 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC2Q9BYS8 371 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 ACAD9Q9H845 621 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 LY9Q9HBG7 655 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO40Q9UH90 709 aa31.55■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 SLC35G1Q2M3R5 365 aa31.54■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 RNF20Q5VTR2 975 aa31.54■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 DDX11Q96FC9 970 aa31.54■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 SLC5A4Q9NY91 659 aa31.54■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 CYBAP13498 195 aa31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 SART3Q15020 963 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRF4Q8IZF3 695 aa31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD35Q8N283 1001 aa31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 MAD2L2Q9UI95 211 aa31.53■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 MCM5P33992 734 aa31.52■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 TROAPQ12815 778 aa31.52■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 TKFCQ3LXA3 575 aa31.52■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 MYL10Q9BUA6 226 aa31.52■■■□□ 2.64
TPGS1-201ENST00000359315 GRM4Q14833 912 aa31.51■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 TCEANC2Q96MN5 208 aa31.51■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 NFIBO00712 420 aa31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 HSPA4P34932 840 aa31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 CNTN2Q02246 1040 aa31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 TSGA10IPQ3SY00 556 aa31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 NEK1Q96PY6 1258 aa31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 JMJD4Q9H9V9 463 aa31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 VAT1LQ9HCJ6 419 aa31.5■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 KLRF2D3W0D1 207 aa31.49■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 TFRCP02786 760 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa31.49■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC4DQ8WXI8 215 aa31.49■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 KCNB2Q92953 911 aa31.49■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 TINF2Q9BSI4 451 aa31.49■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 WDR19Q8NEZ3 1342 aa31.49■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 USH1GQ495M9 461 aa31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 LHX8Q68G74 356 aa31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 NSMFQ6X4W1 530 aa31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF654Q8IZM8 581 aa31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM87BQ96K49 555 aa31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 MTA3Q9BTC8 594 aa31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 ASTN1O14525 1302 aa31.48■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 REC8O95072 547 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 CNGA1P29973 690 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 QRICH1Q2TAL8 776 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 CATIPQ7Z7H3 387 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 FAM133AQ8N9E0 248 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 NUP133Q8WUM0 1156 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 CYP39A1Q9NYL5 469 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 SNX14Q9Y5W7 946 aa31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 SOWAHBA6NEL2 793 aa31.46■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 CPA1P15085 419 aa31.46■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 POTEB2H3BUK9 544 aa31.45■■■□□ 2.63
TPGS1-201ENST00000359315 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms