RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 CHST13Q8NET6 341 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.276e-7■■■□□ 15.7
CXCL2-201ENST00000296031 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 FBXO40Q9UH90 709 aa29.21■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 RPTORQ8N122 1335 aa29.2■■■□□ 2.27
CXCL2-201ENST00000296031 MCM5P33992 734 aa29.2■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.2■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.2■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 PRC1O43663 620 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 ALAS1P13196 640 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 DDX11Q96FC9 970 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 DEFB118Q96PH6 123 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 MTA3Q9BTC8 594 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 CPVLQ9H3G5 476 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 SENP2Q9HC62 589 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 RNF146Q9NTX7 359 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 CCPG1Q9ULG6 757 aa29.19■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 REC8O95072 547 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 ICAM1P05362 532 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 GJA8P48165 433 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 TKFCQ3LXA3 575 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 MAML3Q96JK9 1138 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 ACAD9Q9H845 621 aa29.18■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 SMCHD1A6NHR9 2005 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 IGHA2P01877 340 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 CYP2C19P33261 490 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 RASEFQ8IZ41 740 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 SHISA4Q96DD7 197 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 TRERF1Q96PN7 1200 aa29.17■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.16■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 SGPL1O95470 568 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM87BQ96K49 555 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 NEK1Q96PY6 1258 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 LY9Q9HBG7 655 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 PNMA2Q9UL42 364 aa29.15■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 KRT32Q14532 448 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.14■■■□□ 2.26
CXCL2-201ENST00000296031 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 HSPA4P34932 840 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 TROAPQ12815 778 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 TMTC2Q8N394 836 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.13■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 MYH6P13533 1939 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 KLRF2D3W0D1 207 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 GRM4Q14833 912 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 KCNB2Q92953 911 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.12■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
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CXCL2-201ENST00000296031 CAPN2P17655 700 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 CNGA1P29973 690 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 TINF2Q9BSI4 451 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.11■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 CYBAP13498 195 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 LIFRP42702 1097 aa29.1■■■□□ 2.25
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CXCL2-201ENST00000296031 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 TRPV1Q8NER1 839 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 NUP133Q8WUM0 1156 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 USH1GQ495M9 461 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 NSMFQ6X4W1 530 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 PFASO15067 1338 aa29.09■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC69A6NI79 296 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 POTEB2H3BUK9 544 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 MYL10Q9BUA6 226 aa29.08■■■□□ 2.25
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