RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227474.7

PUS3-201, Transcript of pseudouridylate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUS3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3-201ENST00000227474 APOA5Q6Q788 366 aa9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 GIMAP1Q8WWP7 306 aa9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 B4E1Z4 1266 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 CDKL5O76039 1030 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 IL4RP24394 825 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 SEC13P55735 322 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 TRIM29Q14134 588 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 NTRK3Q16288 839 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 ARMT1Q9H993 441 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 SCN7AQ01118 1682 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 C4AP0C0L4 1744 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 C4BP0C0L5 1744 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 A0A0G2JS52 829 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 PRRT4C9JH25 899 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 CPLX1O14810 134 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 RPS6KA4O75676 772 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 XBP1P17861 261 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 PSMA3P25788 255 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 FANCCQ00597 558 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 GUCY1B3Q02153 619 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 LCORLQ8N3X6 602 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 NEK9Q8TD19 979 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 MAP7D2Q96T17 732 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 KRT23Q9C075 422 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 NAPBQ9H115 298 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 CBX8Q9HC52 389 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 SENP2Q9HC62 589 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 TBK1Q9UHD2 729 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 NARFQ9UHQ1 456 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 ITM2BQ9Y287 266 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 STK36Q9NRP7 1315 aa9.84□□□□□ -0.83
PUS3-201ENST00000227474 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 KIF3CO14782 793 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 PRKAB2O43741 272 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 CCDC159P0C7I6 412 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 RASA1P20936 1047 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 RCAN1P53805 252 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 ADALQ6DHV7 355 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 C12orf49Q9H741 205 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 KIF28PB7ZC32 967 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 ZBTB43O43298 467 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 BBOX1O75936 387 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 CAPN2P17655 700 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 C14orf80Q86SX3 495 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 EFCC1Q9HA90 598 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 HOMER2Q9NSB8 354 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 LUZP4Q9P127 313 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 HOXD10P28358 340 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 PIP4K2BP78356 416 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.82□□□□□ -0.84
PUS3-201ENST00000227474 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms