RNA–Protein interactions for RNA: YOL022C

TSR4, Cytoplasmic protein required for correct processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene TSR4, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TSR4	YOL022C	CTI6	Q08923	506 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SCM3	Q12334	223 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ERP4	Q12450	207 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ARG3	P05150	338 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	CKA1	P15790	372 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	PGS1	P25578	521 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	POL4	P25615	582 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	CDC15	P27636	974 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	UBP13	P38187	747 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RKM3	P38222	552 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RCN2	Q12044	265 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SPE4	Q12455	300 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	GPA1	P08539	472 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	NPL6	P32832	435 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	GCS1	P35197	352 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SPO22	P40511	975 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.43	□□□□□ -1.86	not detected
TSR4	YOL022C	MAF1	P41910	395 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RSM28	Q03430	361 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	NDD1	Q08887	554 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	TCO89	Q08921	799 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	MET17	P06106	444 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	CBS1	P14066	229 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	PEP3	P27801	918 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	PCL6	P40038	420 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RGI2	P40188	164 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ASG1	P40467	964 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	LCL3	P53153	274 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	SWF1	Q04629	336 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	FRE3	Q08905	711 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YCR006C	P25350	157 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	OCA4	P25366	362 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ERG3	P32353	365 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RGT1	P32862	1170 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	MNN2	P38069	597 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	LEU5	P38702	357 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YEL057C	P39983	233 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ECM10	P39987	644 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	UBP8	P50102	471 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YML037C	Q03703	340 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YLR455W	Q06188	304 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	PSR1	Q07800	427 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YEH1	Q07804	573 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TSR4	YOL022C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	PET111	P08468	800 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RED1	P14291	827 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ROX1	P25042	368 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	LHS1	P36016	881 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	AGP2	P38090	596 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	SRO77	P38163	1010 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MET30	P39014	640 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	CCT6	P39079	546 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YAT2	P40017	923 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MRX1	P40050	688 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	BUR6	P40096	142 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	CTK2	P46962	323 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	VPS25	P47142	202 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YPT6	Q99260	215 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YIH1	P25637	258 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	REG2	P38232	338 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YND1	P40009	630 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YIL169C	P40442	995 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	MET28	P40573	187 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	YFR020W	P43600	232 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	ASI1	P54074	624 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TSR4	YOL022C	BET4	Q00618	327 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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