RNA–Protein interactions for RNA: YMR213W

CEF1, Transcript of Essential splicing factor, yeast

Gene CEF1, Length 1,773 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CEF1	YMR213W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	ATG22	P25568	528 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	CTP1	P38152	299 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	EXO5	P38289	585 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	MGE1	P38523	228 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	GIC1	P38785	314 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SBE22	P38814	852 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	VAC8	P39968	578 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	TIR3	P40552	269 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	RTS2	P40962	232 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	AGP3	P43548	558 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	RGD2	P43556	714 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	CTR1	P49573	406 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	COG1	P53079	417 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	GPI1	P53306	609 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SOL4	P53315	255 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	CRR1	Q05790	422 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	FAR10	Q06001	478 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	ULA1	Q12059	462 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SLM3	Q12093	417 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	APN1	P22936	367 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	CNB1	P25296	175 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SPT14	P32363	452 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	HYM1	P32464	399 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	YBR259W	P38338	688 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.28	□□□□□ -1.4	not detected
CEF1	YMR213W	SHU2	P38957	223 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	DUN1	P39009	513 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	PLB1	P39105	664 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SEN34	P39707	275 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	EXO1	P39875	702 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	RTT105	P40063	208 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	MNN5	P46982	586 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	TPN1	P53099	579 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	OKP1	P53298	406 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	CBK1	P53894	756 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	RMI1	Q02685	241 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	REC102	Q02721	264 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	YPL068C	Q02749	293 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	VHS1	Q03785	461 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	UFO1	Q04511	668 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	ARP10	Q04549	284 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	YEH1	Q07804	573 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	ATP14	Q12349	124 aa		6.28	□□□□□ -1.4
CEF1	YMR213W	BI2	P03873	423 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	STE3	P06783	470 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	AEP2	P22136	580 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	ITR1	P30605	584 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	DBF20	P32328	564 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	ECM10	P39987	644 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	TED1	P40533	473 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	YKE4	P40544	346 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	GTT1	P40582	234 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	ROG3	P43602	733 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	IRC18	P47056	224 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	YML6	P51998	286 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	YML131W	Q03102	365 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	GMC2	Q06201	188 aa		6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	STE2	D6VTK4	431 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
CEF1	YMR213W	ABF1	P14164	731 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	SFL1	P20134	766 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	PRI2	P20457	528 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	TRK2	P28584	889 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	GUT2	P32191	649 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	KAP122	P32767	1081 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	SRB2	P34162	210 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	YKL100C	P34248	587 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	YBL086C	P38177	466 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	CST26	P38226	397 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	YBR137W	P38276	179 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	PES4	P39684	611 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	MIT1	P40002	666 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	ASG1	P40467	964 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	SAE2	P46946	345 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	BIO3	P50277	480 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	SLD3	P53135	668 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	RET3	P53600	189 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	RIP-Chip
CEF1	YMR213W	YDR541C	Q03049	344 aa		6.26	□□□□□ -1.41
CEF1	YMR213W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.9 ms