RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	RSF1	Q05043	376 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	ATG26	Q06321	1198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YLR352W	Q06479	807 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	PSR1	Q07800	427 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	NRT1	Q08485	598 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	NDD1	Q08887	554 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	GID7	P25569	745 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RTT107	P38850	1070 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	PHO90	P39535	881 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SIP4	P46954	829 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	SMA1	Q02651	245 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	ENT4	Q07872	247 aa		3.03	□□□□□ -1.92
CSE4	YKL049C	PGS1	P25578	521 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PPZ1	P26570	692 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ARP1	P38696	384 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ANS1	P38832	159 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RGI2	P40188	164 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	FET5	P43561	622 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ATG27	P46989	271 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	DIA3	P52290	468 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PKP2	P53170	491 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ZDS2	P54786	942 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	NUP100	Q02629	959 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	YMR018W	Q04364	514 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	BSC1	Q12140	328 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SKM1	Q12469	655 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	NKP1	Q12493	238 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	CDC23	P16522	626 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PRE8	P23639	250 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	VMA16	P23968	213 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SSH4	P32343	579 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	TRS65	P32893	560 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ERG7	P38604	731 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	DBP8	P38719	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SGM1	P47166	707 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	BSC5	P53755	489 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RAD30	Q04049	632 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	OPY2	Q06810	360 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RDR1	Q08904	546 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	TCO89	Q08921	799 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ARG81	P05085	880 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SNF3	P10870	884 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	BAR1	P12630	587 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ADH7	P25377	361 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	AGP2	P38090	596 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	TSC10	P38342	320 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ELO1	P39540	310 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	YIR014W	P40570	242 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	AZF1	P41696	914 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	YGL260W	P53056	76 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	CUL3	P53202	744 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SOL4	P53315	255 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	MEP3	P53390	489 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	CSR2	Q12734	1121 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	YOR111W	Q99210	232 aa		3	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	GLN3	P18494	730 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	MIC60	P36112	540 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	MAL33	P38157	468 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	UBA4	P38820	440 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RTS1	P38903	757 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	YSA1	Q01976	231 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	GRC3	Q07845	632 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	TEN1	Q07921	160 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PUT2	P07275	575 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	MCM10	P32354	571 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	PHD1	P36093	366 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RIM2	P38127	377 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ECM30	Q06673	1274 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RTT109	Q07794	436 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	CHS3	P29465	1165 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSE4	YKL049C	SPC34	P36131	295 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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